28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1727 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1727  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  643    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.719893  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1635  hypothetical protein  71.43 
 
 		 299 aa  455  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000596322  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1248  hypothetical protein  71.67 
 
 		 299 aa  449  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1504  hypothetical protein  46.94 
 
 		 348 aa  275  6e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2752  hypothetical protein  45.82 
 
 		 342 aa  267  2e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2849  hypothetical protein  39.74 
 
 		 300 aa  213  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2817  hypothetical protein  37.87 
 
 		 307 aa  205  7e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00958093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2890  hypothetical protein  37.09 
 
 		 307 aa  203  4e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0921  hypothetical protein  37.09 
 
 		 307 aa  202  5e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0728  hypothetical protein  39.4 
 
 		 307 aa  202  5e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0791  hypothetical protein  38.87 
 
 		 307 aa  202  5e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0864  hypothetical protein  39.4 
 
 		 307 aa  202  5e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.561346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2914  hypothetical protein  36.75 
 
 		 307 aa  200  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.375403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0674  hypothetical protein  37.42 
 
 		 307 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1006  hypothetical protein  36.42 
 
 		 307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.277831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0582  hypothetical protein  36.42 
 
 		 307 aa  196  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1866  hypothetical protein  37.62 
 
 		 319 aa  189  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.217313  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3840  hypothetical protein  36.96 
 
 		 320 aa  188  8e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.332695 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0956  hypothetical protein  37.62 
 
 		 318 aa  187  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.533596  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1724  hypothetical protein  25.78 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.01564  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3913  putative cytoplasmic protein  26.55 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00327469  normal  0.242388 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1637  virulence-related protein  38.75 
 
 		 230 aa  58.9  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000825616  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0065  virulence-related protein  34.21 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.902286  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0394  hypothetical protein  23.85 
 
 		 232 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2840  hypothetical protein  35.53 
 
 		 230 aa  50.1  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1246  hypothetical protein  41.38 
 
 		 229 aa  49.3  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1091  virulence-related protein  36.92 
 
 		 231 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1481  hypothetical protein  50 
 
 		 206 aa  46.2  0.0006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>