30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1866 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0956  hypothetical protein  98.12 
 
 
318 aa  647    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.533596  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1866  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  661    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.217313  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3840  hypothetical protein  97.5 
 
 
320 aa  629  1e-179  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.332695 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2849  hypothetical protein  60.34 
 
 
300 aa  376  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2817  hypothetical protein  59.66 
 
 
307 aa  368  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00958093  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2890  hypothetical protein  58.97 
 
 
307 aa  366  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155885  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0921  hypothetical protein  58.97 
 
 
307 aa  365  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2914  hypothetical protein  58.62 
 
 
307 aa  363  3e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.375403  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0728  hypothetical protein  58.97 
 
 
307 aa  363  3e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0674  hypothetical protein  59.31 
 
 
307 aa  363  3e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0791  hypothetical protein  58.62 
 
 
307 aa  362  6e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1006  hypothetical protein  58.62 
 
 
307 aa  361  7.0000000000000005e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.277831  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0864  hypothetical protein  58.62 
 
 
307 aa  361  7.0000000000000005e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.561346  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0582  hypothetical protein  58.62 
 
 
307 aa  359  3e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196419  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2752  hypothetical protein  41.75 
 
 
342 aa  242  6e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1504  hypothetical protein  40.27 
 
 
348 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1635  hypothetical protein  38.38 
 
 
299 aa  191  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000596322  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1727  hypothetical protein  37.62 
 
 
307 aa  189  5e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.719893  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1248  hypothetical protein  37.58 
 
 
299 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0065  virulence-related protein  43.01 
 
 
286 aa  79.7  0.00000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.902286  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3913  putative cytoplasmic protein  27.47 
 
 
287 aa  73.6  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00327469  normal  0.242388 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1246  hypothetical protein  38.71 
 
 
229 aa  68.9  0.00000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2840  hypothetical protein  35.42 
 
 
230 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1091  virulence-related protein  36.67 
 
 
231 aa  67.4  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1637  virulence-related protein  36.26 
 
 
230 aa  65.1  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000825616  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0394  hypothetical protein  36.67 
 
 
232 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1481  hypothetical protein  40.48 
 
 
206 aa  57  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1724  hypothetical protein  20.73 
 
 
250 aa  52.8  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.01564  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1014  hypothetical protein  21.92 
 
 
363 aa  42.7  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4438  aminotransferase class-III  37.8 
 
 
427 aa  42.4  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0985724  normal  0.717239 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>