26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1481 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1481  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  429  1e-119  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2840  hypothetical protein  38.22 
 
 
230 aa  159  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1246  hypothetical protein  38.74 
 
 
229 aa  158  5e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1091  virulence-related protein  39.09 
 
 
231 aa  154  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0394  hypothetical protein  37.27 
 
 
232 aa  154  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0065  virulence-related protein  33.61 
 
 
286 aa  144  6e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.902286  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1637  virulence-related protein  32.71 
 
 
230 aa  118  6e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000825616  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1724  hypothetical protein  27.31 
 
 
250 aa  65.5  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.01564  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0956  hypothetical protein  40.48 
 
 
318 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.533596  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3840  hypothetical protein  40.48 
 
 
320 aa  57  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.332695 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1866  hypothetical protein  40.48 
 
 
319 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.217313  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2817  hypothetical protein  40 
 
 
307 aa  55.8  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00958093  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0728  hypothetical protein  40 
 
 
307 aa  54.7  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0864  hypothetical protein  40 
 
 
307 aa  54.7  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.561346  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2752  hypothetical protein  43.94 
 
 
342 aa  54.7  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2914  hypothetical protein  39.53 
 
 
307 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.375403  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2890  hypothetical protein  39.53 
 
 
307 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155885  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0921  hypothetical protein  39.53 
 
 
307 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0674  hypothetical protein  37.65 
 
 
307 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0582  hypothetical protein  39.53 
 
 
307 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196419  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0791  hypothetical protein  38.82 
 
 
307 aa  52.8  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1006  hypothetical protein  37.65 
 
 
307 aa  52.8  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.277831  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2849  hypothetical protein  38.82 
 
 
300 aa  52.4  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1504  hypothetical protein  48.28 
 
 
348 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1727  hypothetical protein  50 
 
 
307 aa  46.2  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.719893  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1635  hypothetical protein  45.24 
 
 
299 aa  42  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000596322  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>