24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8881 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8881  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  476  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2913  secreted protein  54.15 
 
 
293 aa  256  3e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0765  secreted protein  48.31 
 
 
295 aa  224  7e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4891  hypothetical protein  45.63 
 
 
291 aa  224  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4746  hypothetical protein  46.32 
 
 
275 aa  221  8e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.525812  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00290  hypothetical protein  47.68 
 
 
311 aa  220  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.787751 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1789  secreted protein  46.64 
 
 
248 aa  203  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4890  hypothetical protein  41.89 
 
 
300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2481  secreted protein  46.08 
 
 
217 aa  190  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0783  secreted protein  43.35 
 
 
272 aa  185  5e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.358394  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0077  hypothetical protein  40.51 
 
 
335 aa  171  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2531  TM1410 hypothetical-related protein  36.36 
 
 
275 aa  88.2  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0125598  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1840  hypothetical protein  30.53 
 
 
277 aa  77.4  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4700  TM1410 hypothetical-related protein  34.13 
 
 
290 aa  75.5  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.267519  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3224  hypothetical protein  38.6 
 
 
299 aa  71.2  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0681  endo alpha-1,4 polygalactosaminidase precusor  32.31 
 
 
268 aa  70.9  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6731  hypothetical protein  32.54 
 
 
293 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.208284  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01530  endo alpha-1,4 polygalactosaminidase precusor, putative  30.25 
 
 
359 aa  63.2  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2434  TM1410 hypothetical-related protein  31.09 
 
 
296 aa  62.4  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00342831  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3631  hypothetical protein  32.54 
 
 
275 aa  61.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08154  conserved hypothetical protein  29.38 
 
 
336 aa  60.5  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.809637 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02953  endo alpha-1,4 polygalactosaminidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07890)  34.31 
 
 
314 aa  59.7  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2438  hypothetical protein  29.79 
 
 
482 aa  58.5  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.349941  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1078  TM1410 hypothetical-related protein  29.61 
 
 
279 aa  44.7  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.494543 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>