23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4746 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4746  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  565  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.525812  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2913  secreted protein  47.6 
 
 		 293 aa  263  2e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1789  secreted protein  52.28 
 
 		 248 aa  230  2e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0765  secreted protein  49.79 
 
 		 295 aa  222  4.9999999999999996e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8881  hypothetical protein  46.32 
 
 		 231 aa  221  9e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4890  hypothetical protein  40.36 
 
 		 300 aa  198  7.999999999999999e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00290  hypothetical protein  44.13 
 
 		 311 aa  196  3e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.787751 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4891  hypothetical protein  41.37 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0783  secreted protein  48.29 
 
 		 272 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.358394  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0077  hypothetical protein  43.58 
 
 		 335 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2481  secreted protein  42.66 
 
 		 217 aa  149  4e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3224  hypothetical protein  33.12 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0681  endo alpha-1,4 polygalactosaminidase precusor  33.88 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2531  TM1410 hypothetical-related protein  31.35 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0125598  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6731  hypothetical protein  30.64 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.208284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2434  TM1410 hypothetical-related protein  33.14 
 
 		 296 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00342831  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2438  hypothetical protein  37.27 
 
 		 482 aa  54.3  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.349941  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1840  hypothetical protein  33.94 
 
 		 277 aa  52  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4700  TM1410 hypothetical-related protein  32.82 
 
 		 290 aa  50.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.267519  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08154  conserved hypothetical protein  27.33 
 
 		 336 aa  49.3  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.809637 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02953  endo alpha-1,4 polygalactosaminidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07890)  29.66 
 
 		 314 aa  48.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3631  hypothetical protein  29.63 
 
 		 275 aa  47  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01530  endo alpha-1,4 polygalactosaminidase precusor, putative  28.68 
 
 		 359 aa  46.2  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>