25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0765 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0765  secreted protein  100 
 
 
295 aa  593  1e-169  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00290  hypothetical protein  49.65 
 
 
311 aa  237  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.787751 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8881  hypothetical protein  48.31 
 
 
231 aa  224  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4746  hypothetical protein  49.59 
 
 
275 aa  224  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.525812  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0783  secreted protein  53.74 
 
 
272 aa  220  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.358394  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2913  secreted protein  40.75 
 
 
293 aa  206  4e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1789  secreted protein  48.26 
 
 
248 aa  186  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2481  secreted protein  47.25 
 
 
217 aa  186  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4890  hypothetical protein  38.29 
 
 
300 aa  172  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0077  hypothetical protein  45.3 
 
 
335 aa  167  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4891  hypothetical protein  37.45 
 
 
291 aa  162  8.000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2531  TM1410 hypothetical-related protein  34.3 
 
 
275 aa  81.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0125598  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2434  TM1410 hypothetical-related protein  31.84 
 
 
296 aa  70.5  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00342831  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4700  TM1410 hypothetical-related protein  29.31 
 
 
290 aa  66.2  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.267519  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1840  hypothetical protein  29.41 
 
 
277 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3224  hypothetical protein  30.2 
 
 
299 aa  64.7  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0681  endo alpha-1,4 polygalactosaminidase precusor  34.65 
 
 
268 aa  61.6  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08154  conserved hypothetical protein  27.91 
 
 
336 aa  58.9  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.809637 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3631  hypothetical protein  29.71 
 
 
275 aa  56.6  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2438  hypothetical protein  32.58 
 
 
482 aa  55.5  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.349941  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6731  hypothetical protein  31.05 
 
 
293 aa  52.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.208284  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01530  endo alpha-1,4 polygalactosaminidase precusor, putative  30.77 
 
 
359 aa  50.1  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02953  endo alpha-1,4 polygalactosaminidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07890)  26.74 
 
 
314 aa  48.9  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1184  endo alpha-1,4 polygalactosaminidase, putative  28.14 
 
 
313 aa  44.3  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1078  TM1410 hypothetical-related protein  29.92 
 
 
279 aa  42.7  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.494543 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>