26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1840 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1840  hypothetical protein  100 
 
 
277 aa  574  1.0000000000000001e-163  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3631  hypothetical protein  52.92 
 
 
275 aa  307  1.0000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2438  hypothetical protein  50.6 
 
 
482 aa  260  2e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.349941  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2531  TM1410 hypothetical-related protein  48.72 
 
 
275 aa  235  7e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0125598  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1078  TM1410 hypothetical-related protein  51.32 
 
 
279 aa  232  5e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.494543 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3224  hypothetical protein  48.23 
 
 
299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0681  endo alpha-1,4 polygalactosaminidase precusor  43.46 
 
 
268 aa  210  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02953  endo alpha-1,4 polygalactosaminidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07890)  39.18 
 
 
314 aa  189  4e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4700  TM1410 hypothetical-related protein  44.07 
 
 
290 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.267519  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08154  conserved hypothetical protein  36.96 
 
 
336 aa  178  9e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.809637 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2434  TM1410 hypothetical-related protein  42.38 
 
 
296 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00342831  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6731  hypothetical protein  35.45 
 
 
293 aa  152  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.208284  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1184  endo alpha-1,4 polygalactosaminidase, putative  33.04 
 
 
313 aa  129  5.0000000000000004e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3951  hypothetical protein  39.67 
 
 
338 aa  113  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01530  endo alpha-1,4 polygalactosaminidase precusor, putative  32.06 
 
 
359 aa  99.4  5e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00290  hypothetical protein  29.41 
 
 
311 aa  82  0.000000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.787751 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8881  hypothetical protein  30.53 
 
 
231 aa  77.4  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2913  secreted protein  34.48 
 
 
293 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4890  hypothetical protein  36.22 
 
 
300 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0783  secreted protein  30.37 
 
 
272 aa  68.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.358394  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0765  secreted protein  29.41 
 
 
295 aa  65.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4891  hypothetical protein  31.44 
 
 
291 aa  63.5  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0077  hypothetical protein  27.98 
 
 
335 aa  62.4  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2481  secreted protein  34.88 
 
 
217 aa  60.1  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2106  hypothetical protein  22.37 
 
 
302 aa  52.4  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4746  hypothetical protein  33.94 
 
 
275 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.525812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>