26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2434 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2434  TM1410 hypothetical-related protein  100 
 
 
296 aa  595  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00342831  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2438  hypothetical protein  46.86 
 
 
482 aa  204  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.349941  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3631  hypothetical protein  47.2 
 
 
275 aa  204  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2531  TM1410 hypothetical-related protein  48.6 
 
 
275 aa  191  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0125598  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1840  hypothetical protein  42.38 
 
 
277 aa  178  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4700  TM1410 hypothetical-related protein  41.15 
 
 
290 aa  173  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.267519  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1078  TM1410 hypothetical-related protein  43.33 
 
 
279 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.494543 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3224  hypothetical protein  37.89 
 
 
299 aa  156  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08154  conserved hypothetical protein  33.45 
 
 
336 aa  150  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.809637 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0681  endo alpha-1,4 polygalactosaminidase precusor  37.86 
 
 
268 aa  150  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6731  hypothetical protein  30.23 
 
 
293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.208284  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02953  endo alpha-1,4 polygalactosaminidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07890)  33.17 
 
 
314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3951  hypothetical protein  30.38 
 
 
338 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01530  endo alpha-1,4 polygalactosaminidase precusor, putative  32.21 
 
 
359 aa  97.4  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1184  endo alpha-1,4 polygalactosaminidase, putative  30.84 
 
 
313 aa  93.2  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2481  secreted protein  34.33 
 
 
217 aa  78.2  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0783  secreted protein  35.26 
 
 
272 aa  71.6  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.358394  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0765  secreted protein  31.84 
 
 
295 aa  71.6  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00290  hypothetical protein  31.89 
 
 
311 aa  66.2  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.787751 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8881  hypothetical protein  31.09 
 
 
231 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1789  secreted protein  39.02 
 
 
248 aa  58.5  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0077  hypothetical protein  27.7 
 
 
335 aa  57.4  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2913  secreted protein  32.81 
 
 
293 aa  55.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4746  hypothetical protein  32.94 
 
 
275 aa  54.3  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.525812  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4890  hypothetical protein  30 
 
 
300 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4891  hypothetical protein  30.22 
 
 
291 aa  50.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>