21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1789 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1789  secreted protein  100 
 
 		 248 aa  501  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4746  hypothetical protein  52.28 
 
 		 275 aa  229  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.525812  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8881  hypothetical protein  46.64 
 
 		 231 aa  203  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2913  secreted protein  45.87 
 
 		 293 aa  194  8.000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0765  secreted protein  48.66 
 
 		 295 aa  186  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00290  hypothetical protein  46.58 
 
 		 311 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.787751 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0077  hypothetical protein  47.48 
 
 		 335 aa  176  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0783  secreted protein  46.58 
 
 		 272 aa  175  5e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.358394  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4891  hypothetical protein  40.89 
 
 		 291 aa  170  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2481  secreted protein  43.14 
 
 		 217 aa  148  7e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4890  hypothetical protein  38.93 
 
 		 300 aa  148  8e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2531  TM1410 hypothetical-related protein  41.45 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0125598  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3224  hypothetical protein  31.63 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0681  endo alpha-1,4 polygalactosaminidase precusor  30.19 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2434  TM1410 hypothetical-related protein  39.02 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00342831  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2438  hypothetical protein  34.92 
 
 		 482 aa  58.2  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.349941  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4700  TM1410 hypothetical-related protein  30.43 
 
 		 290 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.267519  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01530  endo alpha-1,4 polygalactosaminidase precusor, putative  26.13 
 
 		 359 aa  53.9  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3631  hypothetical protein  33.33 
 
 		 275 aa  49.3  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6731  hypothetical protein  30.77 
 
 		 293 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.208284  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02953  endo alpha-1,4 polygalactosaminidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07890)  26.9 
 
 		 314 aa  45.8  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>