27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2438 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2438  hypothetical protein  100 
 
 
482 aa  988    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.349941  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1078  TM1410 hypothetical-related protein  56.64 
 
 
279 aa  270  5e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.494543 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3631  hypothetical protein  53.19 
 
 
275 aa  266  8.999999999999999e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1840  hypothetical protein  50.6 
 
 
277 aa  260  5.0000000000000005e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2531  TM1410 hypothetical-related protein  50 
 
 
275 aa  256  5e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0125598  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3224  hypothetical protein  51.05 
 
 
299 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0681  endo alpha-1,4 polygalactosaminidase precusor  47.7 
 
 
268 aa  225  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02953  endo alpha-1,4 polygalactosaminidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07890)  46.53 
 
 
314 aa  216  9.999999999999999e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2434  TM1410 hypothetical-related protein  46.86 
 
 
296 aa  203  6e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00342831  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4700  TM1410 hypothetical-related protein  45.38 
 
 
290 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.267519  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08154  conserved hypothetical protein  35.99 
 
 
336 aa  198  2.0000000000000003e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.809637 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6731  hypothetical protein  41.37 
 
 
293 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.208284  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3951  hypothetical protein  35.68 
 
 
338 aa  138  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01530  endo alpha-1,4 polygalactosaminidase precusor, putative  37.78 
 
 
359 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1184  endo alpha-1,4 polygalactosaminidase, putative  32.14 
 
 
313 aa  107  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2913  secreted protein  35.66 
 
 
293 aa  67  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4891  hypothetical protein  35.21 
 
 
291 aa  65.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00290  hypothetical protein  31.25 
 
 
311 aa  65.1  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.787751 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0077  hypothetical protein  27.65 
 
 
335 aa  62.4  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0783  secreted protein  34.65 
 
 
272 aa  59.3  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.358394  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2481  secreted protein  32.81 
 
 
217 aa  58.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8881  hypothetical protein  29.79 
 
 
231 aa  58.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1789  secreted protein  34.92 
 
 
248 aa  58.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0765  secreted protein  32.58 
 
 
295 aa  55.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4890  hypothetical protein  29.17 
 
 
300 aa  53.9  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4746  hypothetical protein  37.61 
 
 
275 aa  53.9  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.525812  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0672  hypothetical protein  32.97 
 
 
322 aa  50.8  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.11675  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>