25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0783 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0783  secreted protein  100 
 
 
272 aa  542  1e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.358394  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0765  secreted protein  53.74 
 
 
295 aa  228  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00290  hypothetical protein  48.56 
 
 
311 aa  204  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.787751 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4746  hypothetical protein  50 
 
 
275 aa  195  9e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.525812  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8881  hypothetical protein  44.21 
 
 
231 aa  189  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1789  secreted protein  46.58 
 
 
248 aa  179  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2481  secreted protein  46.51 
 
 
217 aa  174  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0077  hypothetical protein  44.08 
 
 
335 aa  163  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2913  secreted protein  39.58 
 
 
293 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4891  hypothetical protein  39.38 
 
 
291 aa  162  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4890  hypothetical protein  38.22 
 
 
300 aa  150  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2434  TM1410 hypothetical-related protein  35.26 
 
 
296 aa  73.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00342831  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2531  TM1410 hypothetical-related protein  29.58 
 
 
275 aa  73.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0125598  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1840  hypothetical protein  30.37 
 
 
277 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3224  hypothetical protein  30 
 
 
299 aa  66.2  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0681  endo alpha-1,4 polygalactosaminidase precusor  26.09 
 
 
268 aa  63.9  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2438  hypothetical protein  34.65 
 
 
482 aa  60.5  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.349941  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3631  hypothetical protein  30 
 
 
275 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4700  TM1410 hypothetical-related protein  27.53 
 
 
290 aa  53.1  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.267519  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3951  hypothetical protein  28.99 
 
 
338 aa  52.4  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1078  TM1410 hypothetical-related protein  30.81 
 
 
279 aa  51.6  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.494543 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01530  endo alpha-1,4 polygalactosaminidase precusor, putative  28.37 
 
 
359 aa  52  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08154  conserved hypothetical protein  23.81 
 
 
336 aa  49.3  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.809637 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02953  endo alpha-1,4 polygalactosaminidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07890)  26.59 
 
 
314 aa  47.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6731  hypothetical protein  28.27 
 
 
293 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.208284  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>