More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8242 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8242  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 		 144 aa  294  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824785  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0473  Fur family ferric uptake regulator  63.85 
 
 		 136 aa  174  5e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0918  ferric uptake regulator  61.94 
 
 		 137 aa  168  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0061  FUR family nickel uptake regulator  61.24 
 
 		 150 aa  168  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0654  ferric uptake regulator, Fur family  63.08 
 
 		 136 aa  152  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0375  ferric uptake regulator family protein  52.82 
 
 		 143 aa  150  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0312  ferric uptake regulator family protein  53.24 
 
 		 174 aa  147  6e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4251  FUR family nickel uptake regulator  53.79 
 
 		 139 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0966436  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6149  ferric uptake regulator family protein  57.25 
 
 		 144 aa  137  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.560918 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6836  ferric uptake regulator, Fur family  53.44 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5708  ferric uptake regulator, Fur family  48.55 
 
 		 143 aa  130  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4626  ferric uptake regulator, Fur family  51.45 
 
 		 159 aa  113  7.999999999999999e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.795409  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1315  transcriptional regulator, TrmB  42.54 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0883  ferric uptake regulator, Fur family  44.44 
 
 		 140 aa  108  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.061821  hitchhiker  0.00451054 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0019  ferric uptake regulator family protein  37.5 
 
 		 142 aa  108  3e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0020  FUR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 142 aa  103  7e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147149  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2058  ferric uptake regulator, Fur family  38.76 
 
 		 145 aa  103  9e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_19  transcriptional regulator, Fur family  37.31 
 
 		 142 aa  101  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.677591  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21260  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  42.22 
 
 		 157 aa  99.4  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.570442  normal  0.920787 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  38.58 
 
 		 138 aa  95.9  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0650  ferric uptake regulator family protein  37.5 
 
 		 144 aa  94.4  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000137697  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  31.39 
 
 		 151 aa  90.5  7e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  32.37 
 
 		 154 aa  89.7  1e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  31.16 
 
 		 157 aa  89  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  31.16 
 
 		 157 aa  89  2e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  31.16 
 
 		 157 aa  89  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2661  ferric uptake regulator family protein  38.93 
 
 		 173 aa  88.2  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.946961  normal  0.0414019 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  28.28 
 
 		 145 aa  86.7  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1147  FUR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 135 aa  85.9  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  33.58 
 
 		 155 aa  85.9  2e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  33.85 
 
 		 155 aa  85.1  3e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1746  FUR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 150 aa  85.1  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0199  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 		 150 aa  84.3  5e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.18921  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1147  ferric uptake regulator family protein  34.67 
 
 		 155 aa  84  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2029  FUR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 150 aa  84  7e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0940  ferric uptake regulator, Fur family  27.86 
 
 		 145 aa  84  7e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  32.37 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  32.14 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1645  ferric uptake regulation protein (ferric uptake regulator)  27.54 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1272  ferric uptake regulator family protein  29.71 
 
 		 158 aa  80.5  0.000000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12385  ferric uptake regulation protein furB  35.11 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1048  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000518354  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1064  ferric uptake regulator family protein  33.57 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1415  ferric uptake regulator family protein  37.1 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000163802  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2145  ferric-uptake regulator  35.25 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1411  ferric uptake regulator family protein  34.59 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000449804  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2251  ferric uptake regulator family protein  34.35 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409228  normal  0.662099 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4185  ferric uptake regulator, Fur family  30.37 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.421488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0980  ferric uptake regulator family protein  34.38 
 
 		 135 aa  78.6  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.875301  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1564  ferric uptake regulator family protein  33.57 
 
 		 167 aa  77.8  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0495536  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  35.34 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2790  ferric uptake regulator family protein  30.61 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000512773  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2300  ferric uptake regulator, Fur family  32.86 
 
 		 167 aa  77  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2388  ferric uptake regulator, Fur family  32.86 
 
 		 167 aa  77  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0365  ferric uptake regulator, Fur family  30.87 
 
 		 150 aa  77  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1036  transcriptional regulator, Fur family  30.61 
 
 		 151 aa  77  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0163253  normal  0.210334 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4160  FUR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 151 aa  76.6  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4001  FUR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 151 aa  76.6  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000832394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3832  FUR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 151 aa  76.6  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3848  FUR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 151 aa  76.6  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000844204  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4224  transcriptional regulator, Fur family  30.61 
 
 		 151 aa  76.6  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00546613  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4313  FUR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 151 aa  76.6  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3922  ferric uptake regulator family protein  30.61 
 
 		 151 aa  76.6  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000572819  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4201  transcriptional regulator, Fur family  30.61 
 
 		 151 aa  77  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0217905  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4115  transcriptional regulator, Fur family  30.61 
 
 		 151 aa  76.6  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5116299999999997e-20 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  33.59 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2259  ferric uptake regulator, Fur family  31.54 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2644  ferric uptake regulator family protein  32.84 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  31.58 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  32.81 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1061  FUR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1006  ferric uptake regulator, Fur family  30.61 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000144475 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  33.8 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2798  Fe2+/Zn2+ uptake regulation proteins  32.84 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.1309500000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1084  ferric uptake regulator, Fur family  28.46 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.784641  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0734  ferric uptake regulator family protein  29.58 
 
 		 155 aa  74.3  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000194517  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1586  ferric-uptake regulator  30.14 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.501887  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1555  ferric uptake regulator family protein  30.14 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1806  ferric uptake regulator family protein  37.1 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.696064  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4078  ferric uptake regulator, Fur family  31.39 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000739269  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1261  ferric uptake regulator, Fur family  37.1 
 
 		 141 aa  73.6  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3278  ferric uptake regulator, Fur family  39.22 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.351465 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2543  ferric-uptake regulator  41.67 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37741  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3367  ferric uptake regulator family protein  31.25 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0603  ferric uptake regulator, Fur family  31.43 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0630  FUR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 143 aa  72  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0529  ferric uptake regulator, Fur family  29.85 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000605392  normal  0.102669 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07451  ferric uptake regulator family protein  34.29 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0979772 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1577  ferric uptake regulator, Fur family  30.47 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1138  ferric uptake regulator, Fur family  28.57 
 
 		 143 aa  72  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716078  normal  0.825565 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2725  ferric uptake regulator, Fur family  32.56 
 
 		 152 aa  72.8  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122956  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7202  ferric uptake regulator, Fur family  35.51 
 
 		 128 aa  72  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  32.17 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0842  ferric uptake regulator, Fur family  27.61 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4436  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2620  ferric uptake regulator, Fur family  30.71 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4742  ferric uptake regulator, Fur family  35.61 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  32.03 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  30.37 
 
 		 166 aa  71.2  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>