16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNL06560 on replicon NC_006681
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006681  CNL06560  t-SNARE, putative  100 
 
 		 409 aa  835    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.155233  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02048  SNARE complex subunit (Tlg2), putative (Eurofung)  37.94 
 
 		 386 aa  185  1.0000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000241869  normal  0.351676 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_5512  predicted protein  29.3 
 
 		 247 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.640864 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58577  predicted protein  25.43 
 
 		 358 aa  110  4.0000000000000004e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0646976  normal  0.944639 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13459  predicted protein  31.4 
 
 		 260 aa  110  6e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0504572  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53649  predicted protein  38.37 
 
 		 308 aa  72.8  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.831929  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01520  t-SNARE, putative  41.56 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.151238  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39509  predicted protein  32.61 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.336324 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36316  predicted protein  32.22 
 
 		 279 aa  57  0.0000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.889727  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04416  conserved hypothetical protein, Syntaxin-like (Eurofung)  41.67 
 
 		 273 aa  55.1  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.570807 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90189  SNARE protein SED5/Syntaxin 5  29.67 
 
 		 332 aa  52.8  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0309311  normal  0.0779886 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_27950  predicted protein  34.41 
 
 		 271 aa  50.8  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_09526  Putative ER-Golgi SNARE complex subunit Sed5 (Eurofung)  31.19 
 
 		 344 aa  49.3  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_19932  predicted protein  24.71 
 
 		 301 aa  48.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45972  predicted protein  26.8 
 
 		 294 aa  47  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.587213  normal  0.488793 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02560  syntaxin, putative  29.47 
 
 		 352 aa  44.7  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>