15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_58577 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009044  PICST_58577  predicted protein  100 
 
 		 358 aa  724    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0646976  normal  0.944639 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02048  SNARE complex subunit (Tlg2), putative (Eurofung)  35.13 
 
 		 386 aa  170  4e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000241869  normal  0.351676 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06560  t-SNARE, putative  26.01 
 
 		 409 aa  109  8.000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.155233  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13459  predicted protein  28.03 
 
 		 260 aa  94  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0504572  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_5512  predicted protein  20.23 
 
 		 247 aa  71.6  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.640864 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53649  predicted protein  41.18 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.831929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36316  predicted protein  34.09 
 
 		 279 aa  55.5  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.889727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39509  predicted protein  35.11 
 
 		 271 aa  54.7  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.336324 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01520  t-SNARE, putative  31.58 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.151238  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_09526  Putative ER-Golgi SNARE complex subunit Sed5 (Eurofung)  25.47 
 
 		 344 aa  50.4  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90189  SNARE protein SED5/Syntaxin 5  25.69 
 
 		 332 aa  49.7  0.00009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0309311  normal  0.0779886 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45972  predicted protein  26.27 
 
 		 294 aa  48.5  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.587213  normal  0.488793 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_27950  predicted protein  32.5 
 
 		 271 aa  45.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_6042  predicted protein  28.12 
 
 		 262 aa  43.9  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0493112  normal  0.333418 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04416  conserved hypothetical protein, Syntaxin-like (Eurofung)  32.86 
 
 		 273 aa  42.7  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.570807 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>