16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB01520 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006684  CNB01520  t-SNARE, putative  100 
 
 
291 aa  589  1e-167  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.151238  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04416  conserved hypothetical protein, Syntaxin-like (Eurofung)  33.59 
 
 
273 aa  118  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.570807 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39509  predicted protein  33.33 
 
 
271 aa  112  9e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.336324 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36316  predicted protein  29.17 
 
 
279 aa  94.4  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.889727  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53649  predicted protein  31.68 
 
 
308 aa  84.3  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.831929  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06560  t-SNARE, putative  32.93 
 
 
409 aa  77  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.155233  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02048  SNARE complex subunit (Tlg2), putative (Eurofung)  33.51 
 
 
386 aa  75.1  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000241869  normal  0.351676 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58577  predicted protein  24.56 
 
 
358 aa  62.4  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0646976  normal  0.944639 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13459  predicted protein  26.98 
 
 
260 aa  52  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0504572  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90189  SNARE protein SED5/Syntaxin 5  25.1 
 
 
332 aa  47.4  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0309311  normal  0.0779886 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03350  integral membrane protein sed5, putative  35.42 
 
 
364 aa  46.6  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0595382  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_5512  predicted protein  29.76 
 
 
247 aa  46.6  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.640864 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45881  predicted protein  34.92 
 
 
280 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_19932  predicted protein  28.09 
 
 
301 aa  43.5  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02560  syntaxin, putative  30 
 
 
352 aa  42.7  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_27950  predicted protein  34.83 
 
 
271 aa  42.4  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>