11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_90189 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009046  PICST_90189  SNARE protein SED5/Syntaxin 5  100 
 
 		 332 aa  681    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0309311  normal  0.0779886 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03350  integral membrane protein sed5, putative  39.52 
 
 		 364 aa  230  2e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0595382  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_09526  Putative ER-Golgi SNARE complex subunit Sed5 (Eurofung)  39.22 
 
 		 344 aa  227  2e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_6042  predicted protein  35.17 
 
 		 262 aa  142  9e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0493112  normal  0.333418 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31489  predicted protein  24.3 
 
 		 391 aa  84.3  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06560  t-SNARE, putative  29.67 
 
 		 409 aa  51.6  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.155233  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02048  SNARE complex subunit (Tlg2), putative (Eurofung)  24.55 
 
 		 386 aa  48.9  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000241869  normal  0.351676 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58577  predicted protein  25.69 
 
 		 358 aa  49.3  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0646976  normal  0.944639 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13459  predicted protein  28.35 
 
 		 260 aa  49.3  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0504572  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39509  predicted protein  32.95 
 
 		 271 aa  47  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.336324 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04416  conserved hypothetical protein, Syntaxin-like (Eurofung)  40 
 
 		 273 aa  43.9  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.570807 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>