12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_36316 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009045  PICST_36316  predicted protein  100 
 
 
279 aa  566  1e-160  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.889727  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04416  conserved hypothetical protein, Syntaxin-like (Eurofung)  31.46 
 
 
273 aa  89  8e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.570807 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01520  t-SNARE, putative  29.02 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.151238  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39509  predicted protein  41 
 
 
271 aa  75.5  0.0000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.336324 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53649  predicted protein  32.35 
 
 
308 aa  61.2  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.831929  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06560  t-SNARE, putative  32.22 
 
 
409 aa  57  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.155233  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58577  predicted protein  34.09 
 
 
358 aa  55.5  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0646976  normal  0.944639 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02048  SNARE complex subunit (Tlg2), putative (Eurofung)  36.36 
 
 
386 aa  50.8  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000241869  normal  0.351676 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_09526  Putative ER-Golgi SNARE complex subunit Sed5 (Eurofung)  32.79 
 
 
344 aa  43.9  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02560  syntaxin, putative  22.92 
 
 
352 aa  43.5  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90189  SNARE protein SED5/Syntaxin 5  29.17 
 
 
332 aa  42.4  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0309311  normal  0.0779886 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45881  predicted protein  43.18 
 
 
280 aa  42.4  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>