15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_53649 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_53649  predicted protein  100 
 
 
308 aa  619  1e-176  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.831929  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39509  predicted protein  31.4 
 
 
271 aa  85.9  9e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.336324 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01520  t-SNARE, putative  31.35 
 
 
291 aa  74.7  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.151238  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06560  t-SNARE, putative  34.82 
 
 
409 aa  72.4  0.000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.155233  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58577  predicted protein  41.18 
 
 
358 aa  68.9  0.00000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0646976  normal  0.944639 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04416  conserved hypothetical protein, Syntaxin-like (Eurofung)  28.57 
 
 
273 aa  62.8  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.570807 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36316  predicted protein  32.35 
 
 
279 aa  61.2  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.889727  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13459  predicted protein  36.78 
 
 
260 aa  60.8  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0504572  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02048  SNARE complex subunit (Tlg2), putative (Eurofung)  38.82 
 
 
386 aa  59.7  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000241869  normal  0.351676 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_27950  predicted protein  32.67 
 
 
271 aa  57.8  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_5512  predicted protein  32.56 
 
 
247 aa  57.4  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.640864 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45881  predicted protein  36.51 
 
 
280 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02560  syntaxin, putative  28.89 
 
 
352 aa  43.9  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45877  predicted protein  40.68 
 
 
389 aa  43.1  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_19932  predicted protein  31.65 
 
 
301 aa  42.7  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>