35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1992 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1992  cell envelope biogenesis protein YhbN  100 
 
 		 158 aa  320  6e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0454  cell envelope biogenesis protein YhbN  80.75 
 
 		 161 aa  259  1e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1186  OstA family protein  60.67 
 
 		 155 aa  186  8e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.808934  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0305  OstA family protein  55.7 
 
 		 157 aa  176  9e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.61021  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0666  OstA family protein  50.36 
 
 		 154 aa  145  3e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0658  OstA family protein  41.06 
 
 		 152 aa  125  3e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.301146  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0677  OstA family protein  38.46 
 
 		 153 aa  121  5e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.25138  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0752  OstA family protein  37.82 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.52807  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1350  OstA family protein  36.54 
 
 		 153 aa  115  3e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1077  OstA-like protein  32.05 
 
 		 166 aa  79.3  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0529617  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4365  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  34.03 
 
 		 179 aa  52  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.201613  normal  0.154984 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0974  OstA-like protein  29.2 
 
 		 180 aa  48.9  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0276  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  35.25 
 
 		 190 aa  47.4  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0311412  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0507  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  32.17 
 
 		 185 aa  47.4  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4522  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  32.17 
 
 		 185 aa  47.4  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.599849  normal  0.710923 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3570  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  32.17 
 
 		 185 aa  47.4  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3496  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  32.17 
 
 		 185 aa  47.4  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0500  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  32.17 
 
 		 185 aa  47.4  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.850542  normal  0.391623 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3688  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  32.17 
 
 		 185 aa  47.4  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3393  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  32.17 
 
 		 185 aa  47.4  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3655  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  30 
 
 		 202 aa  46.6  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3813  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  29.49 
 
 		 189 aa  46.2  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.277414  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0283  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  34.68 
 
 		 190 aa  45.8  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3636  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  29.86 
 
 		 157 aa  44.3  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.34297  normal  0.130415 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03065  predicted transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  31.47 
 
 		 185 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000332715  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03016  hypothetical protein  31.47 
 
 		 185 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000479332  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1151  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  32.17 
 
 		 181 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2974  OstA family protein  31.11 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000275423  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0443  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  32.17 
 
 		 181 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3677  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  29.86 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.148558 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3508  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  29.86 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3510  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  29.86 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3615  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  29.86 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.190854 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3579  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  29.86 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0507  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  32.17 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.970543  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>