14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0658 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0658  OstA family protein  100 
 
 
152 aa  304  4.0000000000000004e-82  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.301146  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0677  OstA family protein  56.86 
 
 
153 aa  167  5e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.25138  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0752  OstA family protein  56.86 
 
 
153 aa  166  7e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.52807  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1350  OstA family protein  56.86 
 
 
153 aa  166  1e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1186  OstA family protein  43.51 
 
 
155 aa  126  8.000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.808934  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1992  cell envelope biogenesis protein YhbN  41.06 
 
 
158 aa  125  3e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0305  OstA family protein  44.81 
 
 
157 aa  120  9e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.61021  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0454  cell envelope biogenesis protein YhbN  39.33 
 
 
161 aa  120  9e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0666  OstA family protein  35.56 
 
 
154 aa  89.7  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1077  OstA-like protein  31.76 
 
 
166 aa  72.4  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0529617  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3086  OstA-like protein  24.52 
 
 
184 aa  48.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431766  normal  0.101166 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0226  OstA-like protein  26.32 
 
 
160 aa  45.1  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0956  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  27.78 
 
 
183 aa  43.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.226208 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0173  OstA-like protein  21.53 
 
 
227 aa  41.2  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.65593 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>