29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0666 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0666  OstA family protein  100 
 
 		 154 aa  308  2e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1992  cell envelope biogenesis protein YhbN  49.34 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1186  OstA family protein  50.98 
 
 		 155 aa  147  5e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.808934  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0454  cell envelope biogenesis protein YhbN  48.95 
 
 		 161 aa  144  4.0000000000000006e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0305  OstA family protein  44.81 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.61021  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0752  OstA family protein  32.43 
 
 		 153 aa  103  6e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.52807  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1350  OstA family protein  33.78 
 
 		 153 aa  102  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0677  OstA family protein  32.43 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.25138  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0658  OstA family protein  34 
 
 		 152 aa  93.6  8e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.301146  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1077  OstA-like protein  30.77 
 
 		 166 aa  78.6  0.00000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0529617  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0825  cell envelope biogenesis YhbN  25.19 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3655  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  30.95 
 
 		 202 aa  47.4  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3813  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  30.16 
 
 		 189 aa  46.2  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.277414  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0925  OstA-like protein  23.7 
 
 		 189 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1489  OstA-like protein  24.44 
 
 		 189 aa  43.9  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0428752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0226  OstA-like protein  26.45 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3586  OstA family protein  25.2 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0049  OstA family protein  25.17 
 
 		 221 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162045  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03065  predicted transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  29.41 
 
 		 185 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000332715  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03016  hypothetical protein  29.41 
 
 		 185 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000479332  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0176  OstA-like protein  24.83 
 
 		 221 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.435721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3336  OstA family protein  26.6 
 
 		 179 aa  40.4  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0507  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  29.41 
 
 		 185 aa  40.4  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4522  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  29.41 
 
 		 185 aa  40.4  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.599849  normal  0.710923 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3570  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  29.41 
 
 		 185 aa  40.4  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3496  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  29.41 
 
 		 185 aa  40.4  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0500  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  29.41 
 
 		 185 aa  40.4  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.850542  normal  0.391623 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3688  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  29.41 
 
 		 185 aa  40.4  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3393  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  29.41 
 
 		 185 aa  40.4  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>