34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2569 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2569  hypothetical protein  100 
 
 		 1063 aa  2190    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.682196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4040  hypothetical protein  32.43 
 
 		 473 aa  224  4.9999999999999996e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1065  hypothetical protein  32.51 
 
 		 473 aa  220  1e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0336  Piwi domain protein  28.99 
 
 		 474 aa  198  5.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.412943  normal  0.652066 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1361  piwi domain-containing protein  27.03 
 
 		 473 aa  183  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1066  hypothetical protein  27.99 
 
 		 578 aa  174  5.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4041  hypothetical protein  27.52 
 
 		 579 aa  153  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0434  hypothetical protein  24.14 
 
 		 482 aa  105  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.536677 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3344  hypothetical protein  26.22 
 
 		 474 aa  105  6e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1360  hypothetical protein  25.44 
 
 		 587 aa  100  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3856  hypothetical protein  28.08 
 
 		 480 aa  100  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.010908 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2161  hypothetical protein  22.89 
 
 		 483 aa  99.8  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0335  hypothetical protein  29.41 
 
 		 591 aa  99  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.492672  normal  0.729821 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5756  hypothetical protein  25.29 
 
 		 477 aa  94.7  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4746  piwi domain-containing protein  29.54 
 
 		 256 aa  92  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3762  hypothetical protein  24.68 
 
 		 485 aa  91.3  9e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3109  hypothetical protein  26.87 
 
 		 375 aa  88.2  7e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0104  hypothetical protein  22.69 
 
 		 473 aa  84  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0194  hitchhiker  0.00000595624 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3631  hypothetical protein  24.83 
 
 		 507 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1769  hypothetical protein  25.89 
 
 		 518 aa  80.5  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.032794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02322  hypothetical protein  23.67 
 
 		 888 aa  77  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0201  hypothetical protein  25.81 
 
 		 518 aa  75.9  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.129066  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0554  hypothetical protein  21.94 
 
 		 453 aa  73.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6504  hypothetical protein  25.47 
 
 		 517 aa  72.4  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4271  hypothetical protein  25.42 
 
 		 593 aa  62  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1096  hypothetical protein  23.87 
 
 		 597 aa  62  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0969493  normal  0.343449 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1974  hypothetical protein  23.93 
 
 		 525 aa  58.5  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.136534 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2938  Sir2-like deacetylase  24.4 
 
 		 588 aa  57.8  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1888  hypothetical protein  24.9 
 
 		 593 aa  54.7  0.000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0858825  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1278  putative lipoprotein  25 
 
 		 624 aa  53.9  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246143  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2716  putative transcriptional regulator  21.65 
 
 		 1123 aa  50.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000820476  normal  0.236594 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0055  hypothetical protein  20.81 
 
 		 559 aa  47.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0048  tetratricopeptide domain-containing protein  21.69 
 
 		 897 aa  48.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467809 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1499  NAD-dependent protein deacetylase  32.43 
 
 		 251 aa  45.1  0.008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>