20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3762 on replicon NC_010580
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010580  Bind_3762  hypothetical protein  100 
 
 		 485 aa  999    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0434  hypothetical protein  56.4 
 
 		 482 aa  555  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.536677 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2161  hypothetical protein  40.5 
 
 		 483 aa  349  7e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3856  hypothetical protein  34.83 
 
 		 480 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.010908 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5756  hypothetical protein  32.99 
 
 		 477 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0104  hypothetical protein  32.57 
 
 		 473 aa  243  5e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0194  hitchhiker  0.00000595624 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3344  hypothetical protein  29.05 
 
 		 474 aa  204  4e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1769  hypothetical protein  28.52 
 
 		 518 aa  149  8e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.032794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6504  hypothetical protein  28.05 
 
 		 517 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0201  hypothetical protein  27.45 
 
 		 518 aa  143  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.129066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3631  hypothetical protein  32.9 
 
 		 507 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1974  hypothetical protein  30.46 
 
 		 525 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.136534 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0554  hypothetical protein  25.85 
 
 		 453 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0336  Piwi domain protein  23.77 
 
 		 474 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.412943  normal  0.652066 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1361  piwi domain-containing protein  24.36 
 
 		 473 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4040  hypothetical protein  25.34 
 
 		 473 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1065  hypothetical protein  25.24 
 
 		 473 aa  94  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2569  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1063 aa  91.3  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.682196  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3109  hypothetical protein  22.38 
 
 		 375 aa  78.6  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4746  piwi domain-containing protein  25.76 
 
 		 256 aa  53.5  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>