14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1888 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1888  hypothetical protein  100 
 
 		 593 aa  1215    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0858825  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4271  hypothetical protein  36.68 
 
 		 593 aa  167  4e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1096  hypothetical protein  32.53 
 
 		 597 aa  167  6.9999999999999995e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0969493  normal  0.343449 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2938  Sir2-like deacetylase  33.33 
 
 		 588 aa  160  8e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2243  hypothetical protein  33.6 
 
 		 599 aa  120  7e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1066  hypothetical protein  27.27 
 
 		 578 aa  64.3  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4041  hypothetical protein  26.69 
 
 		 579 aa  63.9  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3439  hypothetical protein  22.14 
 
 		 677 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02322  hypothetical protein  22.68 
 
 		 888 aa  59.7  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2569  hypothetical protein  24.9 
 
 		 1063 aa  54.7  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.682196  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1360  hypothetical protein  30 
 
 		 587 aa  53.9  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1168  hypothetical protein  31.15 
 
 		 549 aa  52  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0335  hypothetical protein  24.89 
 
 		 591 aa  45.4  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.492672  normal  0.729821 
 
 
-
 
NC_002950  PG1014  TPR domain-containing protein  23.32 
 
 		 670 aa  45.1  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.321969 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>