12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1360 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1360  hypothetical protein  100 
 
 		 587 aa  1223    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0335  hypothetical protein  50.52 
 
 		 591 aa  622  1e-177  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.492672  normal  0.729821 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1066  hypothetical protein  30.63 
 
 		 578 aa  262  1e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4041  hypothetical protein  28.9 
 
 		 579 aa  232  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2569  hypothetical protein  25.44 
 
 		 1063 aa  100  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.682196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02322  hypothetical protein  24.55 
 
 		 888 aa  98.2  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1096  hypothetical protein  26.64 
 
 		 597 aa  76.3  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0969493  normal  0.343449 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2938  Sir2-like deacetylase  23.53 
 
 		 588 aa  61.6  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4271  hypothetical protein  25.3 
 
 		 593 aa  55.1  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1888  hypothetical protein  30 
 
 		 593 aa  53.9  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0858825  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1014  TPR domain-containing protein  26.16 
 
 		 670 aa  52.8  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.321969 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2243  hypothetical protein  26.72 
 
 		 599 aa  45.8  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>