16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4041 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_4041  hypothetical protein  100 
 
 
579 aa  1171    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1066  hypothetical protein  66.9 
 
 
578 aa  795    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1360  hypothetical protein  29.43 
 
 
587 aa  246  6e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0335  hypothetical protein  28.81 
 
 
591 aa  228  3e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.492672  normal  0.729821 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2569  hypothetical protein  27.52 
 
 
1063 aa  162  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.682196  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02322  hypothetical protein  26.37 
 
 
888 aa  110  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1096  hypothetical protein  26.3 
 
 
597 aa  90.1  9e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0969493  normal  0.343449 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3439  hypothetical protein  26.72 
 
 
677 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4271  hypothetical protein  28.67 
 
 
593 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2938  Sir2-like deacetylase  29.07 
 
 
588 aa  68.6  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1888  hypothetical protein  26.69 
 
 
593 aa  64.3  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0858825  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1278  putative lipoprotein  25.42 
 
 
624 aa  62.8  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246143  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0055  hypothetical protein  24.5 
 
 
559 aa  62  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0048  tetratricopeptide domain-containing protein  23.68 
 
 
897 aa  61.2  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467809 
 
 
-
 
NC_002950  PG1014  TPR domain-containing protein  27.37 
 
 
670 aa  60.8  0.00000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.321969 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2243  hypothetical protein  31.33 
 
 
599 aa  50.4  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>