21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1278 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1278  putative lipoprotein  100 
 
 		 624 aa  1269    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246143  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0048  tetratricopeptide domain-containing protein  43.19 
 
 		 897 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467809 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0055  hypothetical protein  41.73 
 
 		 559 aa  450  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3439  hypothetical protein  38.3 
 
 		 677 aa  213  7e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4041  hypothetical protein  24.58 
 
 		 579 aa  62  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1096  hypothetical protein  24.1 
 
 		 597 aa  61.6  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0969493  normal  0.343449 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1066  hypothetical protein  24.5 
 
 		 578 aa  56.6  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2938  Sir2-like deacetylase  20.54 
 
 		 588 aa  54.3  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2569  hypothetical protein  25 
 
 		 1063 aa  53.9  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.682196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2433  hypothetical protein  29.17 
 
 		 242 aa  49.7  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.306771  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.5 
 
 		 810 aa  47.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2952  silent information regulator protein Sir2  32.46 
 
 		 264 aa  47  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521347 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2243  hypothetical protein  28.35 
 
 		 599 aa  45.8  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.39 
 
 		 878 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 1421 aa  45.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4271  hypothetical protein  21.98 
 
 		 593 aa  45.1  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  26.77 
 
 		 1276 aa  44.3  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  33.33 
 
 		 587 aa  43.9  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 792 aa  43.9  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  30 
 
 		 1007 aa  43.9  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 		 1192 aa  43.9  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>