18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2243 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2243  hypothetical protein  100 
 
 		 599 aa  1174    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1096  hypothetical protein  32.49 
 
 		 597 aa  261  3e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0969493  normal  0.343449 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4271  hypothetical protein  36.43 
 
 		 593 aa  214  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2938  Sir2-like deacetylase  41.25 
 
 		 588 aa  180  4.999999999999999e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1888  hypothetical protein  32.98 
 
 		 593 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0858825  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1066  hypothetical protein  29.2 
 
 		 578 aa  74.7  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4041  hypothetical protein  30 
 
 		 579 aa  64.7  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1014  TPR domain-containing protein  28.1 
 
 		 670 aa  63.9  0.000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.321969 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3439  hypothetical protein  24.15 
 
 		 677 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0055  hypothetical protein  26.51 
 
 		 559 aa  61.2  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0048  tetratricopeptide domain-containing protein  27.69 
 
 		 897 aa  59.3  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467809 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2569  hypothetical protein  25.93 
 
 		 1063 aa  51.2  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.682196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0335  hypothetical protein  23.81 
 
 		 591 aa  51.2  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.492672  normal  0.729821 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1278  putative lipoprotein  24.77 
 
 		 624 aa  50.1  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246143  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1360  hypothetical protein  24.48 
 
 		 587 aa  48.5  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02322  hypothetical protein  21.56 
 
 		 888 aa  46.6  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0855  hypothetical protein  29.29 
 
 		 511 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.823491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3361  hypothetical protein  27.91 
 
 		 482 aa  43.9  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>