16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1096 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1096  hypothetical protein  100 
 
 		 597 aa  1234    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0969493  normal  0.343449 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4271  hypothetical protein  29.85 
 
 		 593 aa  243  9e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2243  hypothetical protein  32.49 
 
 		 599 aa  240  5.999999999999999e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2938  Sir2-like deacetylase  37.2 
 
 		 588 aa  233  5e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1888  hypothetical protein  32.53 
 
 		 593 aa  167  5.9999999999999996e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0858825  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4041  hypothetical protein  25.97 
 
 		 579 aa  89.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1066  hypothetical protein  26.19 
 
 		 578 aa  82  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1360  hypothetical protein  26.64 
 
 		 587 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0335  hypothetical protein  25.21 
 
 		 591 aa  69.3  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.492672  normal  0.729821 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02322  hypothetical protein  25 
 
 		 888 aa  68.9  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0055  hypothetical protein  24.55 
 
 		 559 aa  62.8  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2569  hypothetical protein  23.87 
 
 		 1063 aa  62  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.682196  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1278  putative lipoprotein  24.1 
 
 		 624 aa  61.6  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246143  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0048  tetratricopeptide domain-containing protein  24.38 
 
 		 897 aa  60.8  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467809 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3439  hypothetical protein  22.26 
 
 		 677 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1014  TPR domain-containing protein  23.44 
 
 		 670 aa  49.7  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.321969 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>