23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3344 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012030  Hlac_3344  hypothetical protein  100 
 
 
474 aa  981    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0434  hypothetical protein  33.12 
 
 
482 aa  229  7e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.536677 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3109  hypothetical protein  36.16 
 
 
375 aa  223  4e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5756  hypothetical protein  31.26 
 
 
477 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0104  hypothetical protein  32.92 
 
 
473 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0194  hitchhiker  0.00000595624 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3856  hypothetical protein  29.53 
 
 
480 aa  205  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.010908 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3762  hypothetical protein  29.05 
 
 
485 aa  204  3e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2161  hypothetical protein  30.44 
 
 
483 aa  201  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6504  hypothetical protein  28.08 
 
 
517 aa  172  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1769  hypothetical protein  28.05 
 
 
518 aa  171  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.032794  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0201  hypothetical protein  26.94 
 
 
518 aa  163  7e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.129066  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3631  hypothetical protein  26.01 
 
 
507 aa  153  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1974  hypothetical protein  25.93 
 
 
525 aa  140  7e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.136534 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0554  hypothetical protein  24.61 
 
 
453 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1361  piwi domain-containing protein  25.1 
 
 
473 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0336  Piwi domain protein  23.33 
 
 
474 aa  111  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.412943  normal  0.652066 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1065  hypothetical protein  25.96 
 
 
473 aa  106  8e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2569  hypothetical protein  26.22 
 
 
1063 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.682196  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4040  hypothetical protein  25.86 
 
 
473 aa  99  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4746  piwi domain-containing protein  29.79 
 
 
256 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3970  stem cell self-renewal protein Piwi domain protein  22.38 
 
 
764 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2716  putative transcriptional regulator  23.71 
 
 
1123 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000820476  normal  0.236594 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3694  hypothetical protein  22.78 
 
 
777 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.560249  normal  0.910445 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>