24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1065 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1065  hypothetical protein  100 
 
 		 473 aa  969    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4040  hypothetical protein  79.07 
 
 		 473 aa  787    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1361  piwi domain-containing protein  41.63 
 
 		 473 aa  373  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0336  Piwi domain protein  40.96 
 
 		 474 aa  367  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.412943  normal  0.652066 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2569  hypothetical protein  32.51 
 
 		 1063 aa  223  7e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.682196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4746  piwi domain-containing protein  43.39 
 
 		 256 aa  189  8e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3344  hypothetical protein  26.11 
 
 		 474 aa  110  8.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0104  hypothetical protein  29.23 
 
 		 473 aa  109  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0194  hitchhiker  0.00000595624 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3631  hypothetical protein  25.14 
 
 		 507 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2161  hypothetical protein  25.31 
 
 		 483 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0201  hypothetical protein  23.64 
 
 		 518 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.129066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3856  hypothetical protein  25.33 
 
 		 480 aa  100  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.010908 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6504  hypothetical protein  23.55 
 
 		 517 aa  99  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5756  hypothetical protein  25.98 
 
 		 477 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3762  hypothetical protein  25.24 
 
 		 485 aa  94.4  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0434  hypothetical protein  29.14 
 
 		 482 aa  94.7  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.536677 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1769  hypothetical protein  23.12 
 
 		 518 aa  93.2  8e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.032794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1974  hypothetical protein  25.71 
 
 		 525 aa  93.2  9e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.136534 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0554  hypothetical protein  21.26 
 
 		 453 aa  79  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2716  putative transcriptional regulator  23.11 
 
 		 1123 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000820476  normal  0.236594 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3109  hypothetical protein  21.69 
 
 		 375 aa  50.8  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3970  stem cell self-renewal protein Piwi domain protein  20.38 
 
 		 764 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2500  stem cell self-renewal protein Piwi domain protein  20.15 
 
 		 631 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440575  normal  0.181301 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2785  stem cell self-renewal protein Piwi domain protein  26.55 
 
 		 718 aa  45.1  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>