73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4756 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4756  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  100 
 
 		 210 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184119  normal  0.709041 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2652  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  40.4 
 
 		 195 aa  145  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3442  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  42.27 
 
 		 198 aa  139  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5263  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  41.67 
 
 		 198 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297316  normal  0.572597 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4018  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  41.15 
 
 		 195 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.264254 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3500  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  41.15 
 
 		 199 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.209657 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2125  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  34.21 
 
 		 184 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228157  hitchhiker  0.0000391115 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5868  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  33.85 
 
 		 198 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.767299  normal  0.392985 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2110  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  38.16 
 
 		 205 aa  92  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4624  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  32.12 
 
 		 198 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4258  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  32.12 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.654694 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4775  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  32.99 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2161  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  31.16 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0508261  normal  0.780711 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0254  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  32.63 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0798  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  28.65 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0262  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  33.16 
 
 		 198 aa  67.8  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0364941 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0745  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  31.94 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1512  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  27.27 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000362889  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4023  putative pyridoxamine-phosphate oxidase  26.83 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.323622  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2144  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  25.73 
 
 		 193 aa  62  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2192  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  25.73 
 
 		 193 aa  62  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1590  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  26.59 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.012527 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1580  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  26.37 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0367191  normal  0.0444647 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0095  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  27.91 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.905339 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1068  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  29.03 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.326405  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2100  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.27 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00869837 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0774  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  26.67 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4053  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  23.33 
 
 		 184 aa  48.5  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000260604  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0155  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  37.18 
 
 		 211 aa  48.5  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.923059  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0885  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  25.91 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3947  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  26.06 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.932005 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2143  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  36.78 
 
 		 167 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.429446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0778  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  35.87 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4813  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  26.16 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.134817  normal  0.171584 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0628  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  35.87 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1669  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  26.35 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.297352 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1789  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  32.04 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00011634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0815  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  36.05 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.554957  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1458  hypothetical protein  32.97 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50800  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  25.5 
 
 		 215 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587779 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0186  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  26.97 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626116  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3018  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  26.19 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.855594  hitchhiker  0.0018196 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0857  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  29.84 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10301  hypothetical protein  35.62 
 
 		 180 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.143046  hitchhiker  0.00037794 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4664  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  25.58 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.187726 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2671  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  34.48 
 
 		 180 aa  43.9  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.455745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4331  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  24.24 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262405  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0531  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  37.04 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4295  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  25.58 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0350  hypothetical protein  35.62 
 
 		 180 aa  43.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0960796  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1519  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  40.3 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000729179 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4106  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  36.21 
 
 		 163 aa  43.1  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.318371  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0594  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  35.62 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4563  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  30.23 
 
 		 167 aa  42.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.535991  normal  0.356279 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5080  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  30.23 
 
 		 167 aa  43.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.71556 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2642  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.88 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3130  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  33.33 
 
 		 218 aa  42.7  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0379301  normal  0.139192 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1389  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  31.11 
 
 		 212 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15441  hypothetical protein  28.05 
 
 		 183 aa  42.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.490668  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1205  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  32.22 
 
 		 212 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.692006 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1026  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  32.88 
 
 		 206 aa  42.7  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.392091  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1007  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  29.17 
 
 		 216 aa  42  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0693  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.66 
 
 		 199 aa  42  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.73499  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0787  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  32.67 
 
 		 212 aa  42  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109615  normal  0.222265 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0931  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  32.94 
 
 		 199 aa  42  0.007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.151005  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0416  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  32.65 
 
 		 208 aa  42  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.867273  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4286  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.4 
 
 		 215 aa  42  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02327  Pyridoxamine 5-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  25.69 
 
 		 189 aa  42  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.437223  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1229  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  31.96 
 
 		 215 aa  41.6  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5023  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  29.07 
 
 		 167 aa  41.6  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.140709  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0424  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  32.22 
 
 		 208 aa  41.6  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0831  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  37.5 
 
 		 218 aa  41.6  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.328112  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0443  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  32.67 
 
 		 218 aa  41.6  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.732477  normal  0.141335 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>