61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5868 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5868  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  100 
 
 		 198 aa  392  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.767299  normal  0.392985 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4775  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  53.54 
 
 		 198 aa  188  4e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2161  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  52.79 
 
 		 200 aa  185  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0508261  normal  0.780711 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4624  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  51.01 
 
 		 198 aa  177  9e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4258  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  50.51 
 
 		 198 aa  174  6e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.654694 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1512  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  38.95 
 
 		 209 aa  132  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000362889  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3500  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  38.14 
 
 		 199 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.209657 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3442  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  37.24 
 
 		 198 aa  121  8e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5263  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  36.92 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297316  normal  0.572597 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2652  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  36.41 
 
 		 195 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4018  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  36.6 
 
 		 195 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.264254 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2110  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  40.82 
 
 		 205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0745  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  37.7 
 
 		 223 aa  111  9e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2125  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  33.68 
 
 		 184 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228157  hitchhiker  0.0000391115 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4756  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  33.85 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184119  normal  0.709041 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4023  putative pyridoxamine-phosphate oxidase  30.2 
 
 		 215 aa  91.3  9e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.323622  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0095  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  30.48 
 
 		 202 aa  84.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.905339 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0254  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  32.98 
 
 		 174 aa  83.2  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1580  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  35.38 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0367191  normal  0.0444647 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0798  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  32.65 
 
 		 189 aa  74.7  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0262  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  34.73 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0364941 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10301  hypothetical protein  25 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.143046  hitchhiker  0.00037794 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0350  hypothetical protein  24.32 
 
 		 180 aa  61.2  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0960796  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1765  hypothetical protein  31.21 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0335869 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1458  hypothetical protein  29.14 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3018  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  30.77 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.855594  hitchhiker  0.0018196 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2144  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  34.38 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2192  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  34.38 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15441  hypothetical protein  24.44 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.490668  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4053  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  23.84 
 
 		 184 aa  48.5  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000260604  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15591  hypothetical protein  24.86 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.63845  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1456  hypothetical protein  25.56 
 
 		 183 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0774  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  27.81 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1669  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  30.19 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.297352 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2100  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  40 
 
 		 210 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00869837 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4542  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  32.05 
 
 		 214 aa  45.1  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50800  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  30.58 
 
 		 215 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587779 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24050  pyridoxamine-phosphate oxidase  37.63 
 
 		 250 aa  44.7  0.0009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4331  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  36.92 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262405  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1229  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  33.98 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0248  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  32.5 
 
 		 221 aa  43.5  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0443  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.66 
 
 		 218 aa  42.7  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.732477  normal  0.141335 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0332  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  38.81 
 
 		 211 aa  42.7  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.207205 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1519  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  37.5 
 
 		 214 aa  42.7  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000729179 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0815  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  38.46 
 
 		 212 aa  42.4  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.554957  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0654  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  32.97 
 
 		 216 aa  42.4  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.273077  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3853  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  35.38 
 
 		 215 aa  42.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0541085  normal  0.804089 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1957  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  36.76 
 
 		 214 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2372  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  38.89 
 
 		 229 aa  42.4  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2642  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  36.36 
 
 		 212 aa  42.4  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1068  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  37.5 
 
 		 210 aa  42.4  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.326405  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2568  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  36.76 
 
 		 214 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387899  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1590  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  34.38 
 
 		 197 aa  42  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.012527 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2592  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  36.76 
 
 		 214 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.984906 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1900  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  36.92 
 
 		 215 aa  42  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225533  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0417  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  31.34 
 
 		 213 aa  42  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4813  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.09 
 
 		 214 aa  41.6  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.134817  normal  0.171584 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5900  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  36.76 
 
 		 214 aa  41.6  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.495337 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4754  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  35.94 
 
 		 200 aa  41.6  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.1157  normal  0.0209318 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1067  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  38.46 
 
 		 211 aa  41.6  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2888  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  32.93 
 
 		 210 aa  41.2  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877962  normal  0.487747 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>