76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4624 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_4624  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  100 
 
 
198 aa  395  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4258  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  95.96 
 
 
198 aa  345  2e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.654694 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4775  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  84.85 
 
 
198 aa  321  4e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2161  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  62.05 
 
 
200 aa  222  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0508261  normal  0.780711 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5868  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  51.01 
 
 
198 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.767299  normal  0.392985 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3442  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  35.18 
 
 
198 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4018  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  35.53 
 
 
195 aa  104  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.264254 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3500  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  35.03 
 
 
199 aa  104  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.209657 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2110  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  39.46 
 
 
205 aa  101  8e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5263  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  34.17 
 
 
198 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297316  normal  0.572597 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2652  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  35.56 
 
 
195 aa  98.6  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1512  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  34.22 
 
 
209 aa  97.8  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000362889  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0745  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  37.7 
 
 
223 aa  97.1  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2125  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  31.91 
 
 
184 aa  91.7  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228157  hitchhiker  0.0000391115 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4023  putative pyridoxamine-phosphate oxidase  32.5 
 
 
215 aa  89.4  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.323622  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0095  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  32.34 
 
 
202 aa  85.9  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.905339 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4756  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  32.12 
 
 
210 aa  85.1  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184119  normal  0.709041 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0254  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  33.51 
 
 
174 aa  82.8  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0798  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  34.41 
 
 
189 aa  81.3  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1580  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  28.92 
 
 
212 aa  72  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0367191  normal  0.0444647 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2144  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  24.21 
 
 
193 aa  58.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2192  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  24.21 
 
 
193 aa  58.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0262  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  32.05 
 
 
198 aa  58.9  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0364941 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1456  hypothetical protein  25.74 
 
 
183 aa  57.4  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0774  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  27.11 
 
 
193 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15591  hypothetical protein  28.76 
 
 
183 aa  54.3  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.63845  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15441  hypothetical protein  26.6 
 
 
183 aa  53.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.490668  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1590  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  25.58 
 
 
197 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.012527 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15191  hypothetical protein  26.19 
 
 
183 aa  51.6  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3018  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  25.9 
 
 
201 aa  50.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.855594  hitchhiker  0.0018196 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43552  predicted protein  37.36 
 
 
282 aa  50.8  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0582  hypothetical protein  27.54 
 
 
215 aa  50.1  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0601  hypothetical protein  27.54 
 
 
215 aa  50.1  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1765  hypothetical protein  29.79 
 
 
192 aa  48.1  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0335869 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2345  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  36.36 
 
 
200 aa  48.1  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4053  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  26.79 
 
 
184 aa  47.8  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000260604  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2153  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  29.76 
 
 
225 aa  46.6  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0107  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  42.03 
 
 
214 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000023808  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0904  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  42.03 
 
 
214 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0158513  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1061  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  42.03 
 
 
214 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.040983  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0901  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  42.03 
 
 
214 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.901665  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0359  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  42.03 
 
 
214 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0016328  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1775  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.85 
 
 
215 aa  47  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1020  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  35.45 
 
 
200 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.137721  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0858  pyridoxamine-phosphate oxidase  37.36 
 
 
220 aa  47  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.911658  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2494  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  42.03 
 
 
214 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00659427  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0659  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  42.03 
 
 
214 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0194138  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10301  hypothetical protein  25.17 
 
 
180 aa  46.2  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.143046  hitchhiker  0.00037794 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3130  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  28.73 
 
 
218 aa  45.8  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0379301  normal  0.139192 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0717  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  40.58 
 
 
265 aa  45.8  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000096585  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1519  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  43.75 
 
 
214 aa  45.4  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000729179 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02327  Pyridoxamine 5-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  26.01 
 
 
189 aa  45.4  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.437223  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0350  hypothetical protein  24.49 
 
 
180 aa  45.1  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0960796  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3221  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  39.13 
 
 
213 aa  45.1  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110352  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39880  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  40 
 
 
215 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09410  pyrodoxamine 5'-phosphate oxidase  40 
 
 
215 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0829  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  28.04 
 
 
212 aa  44.3  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0741  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  39.13 
 
 
213 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.643542  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2475  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  36.96 
 
 
206 aa  44.7  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.102902  normal  0.0239297 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1669  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  35.62 
 
 
194 aa  43.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.297352 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0186  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  41.79 
 
 
213 aa  43.5  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626116  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1458  hypothetical protein  25.62 
 
 
189 aa  43.1  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0443  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  36.56 
 
 
218 aa  43.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.732477  normal  0.141335 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1067  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.83 
 
 
211 aa  42.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1148  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  38.46 
 
 
201 aa  42.4  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  unclonable  0.000000000148678  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4286  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  29.01 
 
 
215 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2888  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  28.24 
 
 
210 aa  42.7  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877962  normal  0.487747 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1229  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  32.14 
 
 
215 aa  42.4  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4116  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  35.82 
 
 
215 aa  42.4  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.225541  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1052  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  40 
 
 
200 aa  42  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3033  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  32.52 
 
 
199 aa  41.6  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.312491  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1699  pyridoxal 5'-phosphate synthase  30.06 
 
 
194 aa  41.6  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000942056  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0514  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  31.52 
 
 
212 aa  41.6  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.439872  normal  0.298122 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1129  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  29.01 
 
 
215 aa  41.2  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425892 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3853  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  30.95 
 
 
215 aa  41.6  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0541085  normal  0.804089 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1165  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  29.01 
 
 
215 aa  41.2  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>