67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0095 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0095  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  100 
 
 		 202 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.905339 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0798  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  58.55 
 
 		 189 aa  230  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2110  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  34.92 
 
 		 205 aa  96.3  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2161  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  34.67 
 
 		 200 aa  91.3  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0508261  normal  0.780711 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5868  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  30.48 
 
 		 198 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.767299  normal  0.392985 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4018  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  30.54 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.264254 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3500  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  30.15 
 
 		 199 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.209657 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1580  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  29.9 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0367191  normal  0.0444647 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4258  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  32.34 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.654694 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1512  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  32.12 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000362889  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2652  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  29.02 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4775  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  32.98 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4624  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  31.34 
 
 		 198 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3442  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  27.96 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2144  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  29.57 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2192  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  29.57 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2125  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  28.9 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228157  hitchhiker  0.0000391115 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0262  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  32.04 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0364941 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5263  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  26.2 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297316  normal  0.572597 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1590  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  29.53 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.012527 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02327  Pyridoxamine 5-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  28.98 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.437223  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15591  hypothetical protein  27.47 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.63845  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3018  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  26.83 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.855594  hitchhiker  0.0018196 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1456  hypothetical protein  26.6 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15441  hypothetical protein  29.75 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.490668  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4023  putative pyridoxamine-phosphate oxidase  28.87 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.323622  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0774  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  29.89 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4756  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  27.91 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184119  normal  0.709041 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10301  hypothetical protein  25.52 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.143046  hitchhiker  0.00037794 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0350  hypothetical protein  24 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0960796  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4053  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  27.59 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000260604  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0717  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  33.03 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.170701 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0767  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  32.11 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0778  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  40.58 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0628  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  40.58 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1519  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.38 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000729179 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0787  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  32.11 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109615  normal  0.222265 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1067  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.57 
 
 		 211 aa  48.5  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0514  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  33.33 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.439872  normal  0.298122 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3221  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.78 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1669  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  27.06 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.297352 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0423  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.62 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190408  normal  0.079885 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1311  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  35.62 
 
 		 233 aa  44.7  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.279184  normal  0.369294 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0741  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  25.93 
 
 		 213 aa  43.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.643542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0443  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  35 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.732477  normal  0.141335 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50800  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  33.33 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587779 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1150  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  32.88 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.343525  normal  0.105039 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2153  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  36.23 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1358  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.62 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.426968  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0359  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  26.55 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0016328  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0815  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.15 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.554957  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1061  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  26.55 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.040983  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0659  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  26.55 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0194138  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2494  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  26.55 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00659427  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0901  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  26.55 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.901665  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0904  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  26.55 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0158513  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0107  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  26.55 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000023808  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4331  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  33.33 
 
 		 215 aa  42.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262405  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0582  hypothetical protein  25.62 
 
 		 215 aa  42.7  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2893  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  30.68 
 
 		 213 aa  42.4  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0601  hypothetical protein  25.62 
 
 		 215 aa  42.4  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3130  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  33.33 
 
 		 218 aa  42.4  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0379301  normal  0.139192 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1900  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  33.33 
 
 		 215 aa  42.4  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225533  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41681  predicted protein  26.15 
 
 		 220 aa  41.6  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0254  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  27.74 
 
 		 174 aa  41.6  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0717  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  26.13 
 
 		 265 aa  41.2  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000096585  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4286  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  33.33 
 
 		 215 aa  41.2  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>