94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0745 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0745  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  100 
 
 		 223 aa  432  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5868  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  37.7 
 
 		 198 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.767299  normal  0.392985 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4023  putative pyridoxamine-phosphate oxidase  35.94 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.323622  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1512  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  33.84 
 
 		 209 aa  105  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000362889  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1580  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  32.69 
 
 		 212 aa  95.9  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0367191  normal  0.0444647 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2652  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  34.18 
 
 		 195 aa  89.7  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4018  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  38.04 
 
 		 195 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.264254 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3500  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  36.81 
 
 		 199 aa  89  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.209657 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4775  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  36.07 
 
 		 198 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5263  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  36.26 
 
 		 198 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297316  normal  0.572597 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2110  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  33.16 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3442  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  37.08 
 
 		 198 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4258  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  35.52 
 
 		 198 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.654694 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4624  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  35.52 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2161  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  36.02 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0508261  normal  0.780711 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2125  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  26.2 
 
 		 184 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228157  hitchhiker  0.0000391115 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4756  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  31.94 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184119  normal  0.709041 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0798  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  31.49 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2192  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  29.11 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0254  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  32.37 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2144  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  29.11 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0262  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  34.66 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0364941 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15591  hypothetical protein  25.17 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.63845  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2153  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  39.33 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15441  hypothetical protein  25.15 
 
 		 183 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.490668  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3018  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  35.62 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.855594  hitchhiker  0.0018196 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1519  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.31 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000729179 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1765  hypothetical protein  29.52 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0335869 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1229  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  32.74 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0778  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  35.23 
 
 		 218 aa  49.3  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0628  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  35.23 
 
 		 218 aa  49.3  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4331  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  32.74 
 
 		 215 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262405  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1669  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  32.88 
 
 		 194 aa  48.5  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.297352 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50800  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  32.74 
 
 		 215 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587779 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3221  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  37.08 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0815  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  35.96 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.554957  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0659  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.83 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0194138  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0601  hypothetical protein  28.42 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1061  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.83 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.040983  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0717  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  33.71 
 
 		 265 aa  47  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000096585  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0359  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.83 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0016328  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0514  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  32.8 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.439872  normal  0.298122 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0904  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.83 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0158513  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0901  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.83 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.901665  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0107  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.83 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000023808  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2494  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.83 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00659427  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0582  hypothetical protein  27.37 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0787  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  33.71 
 
 		 212 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109615  normal  0.222265 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1165  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  30.09 
 
 		 215 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1129  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  30.09 
 
 		 215 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425892 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0741  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  35.96 
 
 		 213 aa  45.8  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.643542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4286  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  30.09 
 
 		 215 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3853  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  31.86 
 
 		 215 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0541085  normal  0.804089 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1150  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  30.09 
 
 		 215 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.343525  normal  0.105039 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0443  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  29.19 
 
 		 218 aa  45.1  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.732477  normal  0.141335 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1458  hypothetical protein  25.93 
 
 		 189 aa  45.1  0.0009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0717  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  32.58 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.170701 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2922  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  33.33 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.969034 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1243  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  38.46 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0527508 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3130  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  36.79 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0379301  normal  0.139192 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0885  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.78 
 
 		 193 aa  44.3  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0363  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  30.34 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.138758  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2592  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  33.71 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.984906 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2568  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  33.71 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387899  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1900  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.85 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225533  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4754  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  38.1 
 
 		 200 aa  43.9  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.1157  normal  0.0209318 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1957  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  33.71 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1068  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  31.21 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.326405  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0767  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  32.58 
 
 		 212 aa  43.5  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1067  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  36.36 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1988  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  33.71 
 
 		 196 aa  43.1  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000145695  normal  0.0355751 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0557  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  33.01 
 
 		 214 aa  43.5  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.365319  normal  0.0595481 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2642  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  29.21 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0521  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.88 
 
 		 214 aa  42.7  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.745375  hitchhiker  0.00802215 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43552  predicted protein  32.98 
 
 		 282 aa  42.7  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5080  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  28.87 
 
 		 167 aa  42.4  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.71556 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4116  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  29.13 
 
 		 215 aa  42.4  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.225541  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0394  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  31.03 
 
 		 215 aa  42.4  0.006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.17512  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0332  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  33.71 
 
 		 211 aa  42.4  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.207205 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4053  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  28.57 
 
 		 184 aa  42.4  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000260604  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0186  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  37.88 
 
 		 213 aa  42.4  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626116  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1016  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.78 
 
 		 196 aa  42  0.007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1358  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  28.23 
 
 		 216 aa  42  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.426968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0835  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  30.71 
 
 		 200 aa  42  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1146  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.78 
 
 		 196 aa  42  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1455  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.04 
 
 		 198 aa  42  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.789221  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2372  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  37.31 
 
 		 229 aa  42  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1590  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  26.8 
 
 		 197 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.012527 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5900  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  31.15 
 
 		 214 aa  41.6  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.495337 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3489  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  38.46 
 
 		 214 aa  41.6  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.481543  normal  0.892372 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2494  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  33.68 
 
 		 210 aa  41.6  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01800  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  42  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.853891  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2407  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.04 
 
 		 198 aa  41.6  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576052  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2487  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  32.58 
 
 		 214 aa  41.6  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.262881 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>