79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0774 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0774  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  100 
 
 
193 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1669  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  58.25 
 
 
194 aa  223  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.297352 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3018  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  53.72 
 
 
201 aa  214  5.9999999999999996e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.855594  hitchhiker  0.0018196 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1590  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  53.44 
 
 
197 aa  202  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.012527 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2192  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  50.79 
 
 
193 aa  193  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2144  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  50.79 
 
 
193 aa  193  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0070  hypothetical protein  51.32 
 
 
186 aa  157  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02327  Pyridoxamine 5-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  38.3 
 
 
189 aa  136  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.437223  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4053  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  35.57 
 
 
184 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000260604  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1765  hypothetical protein  37.04 
 
 
192 aa  107  7.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0335869 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1458  hypothetical protein  35.98 
 
 
189 aa  105  4e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41681  predicted protein  35.02 
 
 
220 aa  105  5e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47090  predicted protein  34.55 
 
 
303 aa  93.6  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15441  hypothetical protein  29.74 
 
 
183 aa  85.5  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.490668  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0350  hypothetical protein  28.95 
 
 
180 aa  83.2  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0960796  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10301  hypothetical protein  29.47 
 
 
180 aa  83.6  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.143046  hitchhiker  0.00037794 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15591  hypothetical protein  27.51 
 
 
183 aa  78.2  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.63845  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1456  hypothetical protein  26.46 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15191  hypothetical protein  27.13 
 
 
183 aa  75.9  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43552  predicted protein  40 
 
 
282 aa  60.8  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0095  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  29.89 
 
 
202 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.905339 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3500  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  29.48 
 
 
199 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.209657 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4018  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  30.06 
 
 
195 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.264254 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2110  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  27.98 
 
 
205 aa  55.8  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2652  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  28.9 
 
 
195 aa  53.9  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4258  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  26.51 
 
 
198 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.654694 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4624  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  25.9 
 
 
198 aa  52  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4756  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  26.67 
 
 
210 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184119  normal  0.709041 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01800  hypothetical protein  27.2 
 
 
182 aa  49.3  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.853891  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4775  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  26.67 
 
 
198 aa  47.8  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4286  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.84 
 
 
215 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0798  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  26.9 
 
 
189 aa  47.8  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3442  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  28.32 
 
 
198 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19500  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  26.8 
 
 
215 aa  47.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.187849  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3853  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  26.8 
 
 
215 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0541085  normal  0.804089 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05820  Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  32.43 
 
 
186 aa  46.6  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.300525 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1129  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.84 
 
 
215 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425892 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1165  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.84 
 
 
215 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2888  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  29.17 
 
 
210 aa  47  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877962  normal  0.487747 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0254  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  29.34 
 
 
174 aa  46.6  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4116  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.91 
 
 
215 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.225541  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0601  hypothetical protein  28.75 
 
 
215 aa  46.2  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0582  hypothetical protein  28.75 
 
 
215 aa  46.2  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1775  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  28.4 
 
 
215 aa  45.8  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5868  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  27.81 
 
 
198 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.767299  normal  0.392985 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1519  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  29.07 
 
 
214 aa  45.8  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000729179 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2817  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  25.29 
 
 
211 aa  45.8  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.878112  normal  0.0808941 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1229  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.84 
 
 
215 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1509  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  26.25 
 
 
214 aa  45.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000501004 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1243  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.5 
 
 
213 aa  45.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0527508 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1358  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  30.49 
 
 
216 aa  45.4  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.426968  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0443  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  29.57 
 
 
218 aa  45.4  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.732477  normal  0.141335 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2487  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.5 
 
 
214 aa  45.1  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.262881 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1007  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  30.49 
 
 
216 aa  44.7  0.0008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2616  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.5 
 
 
214 aa  44.7  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2058  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  24 
 
 
217 aa  44.3  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.183278  normal  0.448099 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1782  pyridoxamine-phosphate oxidase  31.37 
 
 
201 aa  43.9  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1150  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  25.77 
 
 
215 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.343525  normal  0.105039 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0728  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.5 
 
 
214 aa  43.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2627  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  23.53 
 
 
201 aa  43.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.752106  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1881  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  23.12 
 
 
217 aa  43.9  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5263  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  28.65 
 
 
198 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297316  normal  0.572597 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0423  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  23.6 
 
 
211 aa  43.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190408  normal  0.079885 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0363  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.06 
 
 
216 aa  43.1  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.138758  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0885  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  25.81 
 
 
193 aa  42.4  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1196  Pyridoxal 5'-phosphate synthase  32.31 
 
 
217 aa  42.7  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.251178  normal  0.185067 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2125  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  36.76 
 
 
184 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228157  hitchhiker  0.0000391115 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2100  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  26.19 
 
 
210 aa  42.4  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00869837 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5900  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.5 
 
 
214 aa  42  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.495337 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50800  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.66 
 
 
215 aa  42  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587779 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0186  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  25.29 
 
 
213 aa  42  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626116  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2592  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.5 
 
 
214 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.984906 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3586  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  23.96 
 
 
215 aa  42  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.63325  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2568  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.5 
 
 
214 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387899  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1957  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.5 
 
 
214 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1436  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.16 
 
 
215 aa  41.6  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0724  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  24.86 
 
 
209 aa  41.2  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.690849  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0634  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  25.88 
 
 
206 aa  41.2  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.119469 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11923  Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  24.86 
 
 
213 aa  41.2  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227321  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>