More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3904 on replicon NC_010578
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0610  steroid monooxygenase  69.94 
 
 
606 aa  803    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0189312 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1351  steroid monooxygenase  69.57 
 
 
541 aa  801    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.881234  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0393  steroid monooxygenase  64.02 
 
 
543 aa  750    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3461  FAD dependent oxidoreductase  65.15 
 
 
548 aa  761    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00115116  normal  0.0283002 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2283  phenylacetone monooxygenase  65.16 
 
 
554 aa  742    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0088  steroid monooxygenase  66.42 
 
 
533 aa  764    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3904  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
548 aa  1147    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.955647  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1837  FAD dependent oxidoreductase  65.69 
 
 
547 aa  780    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131168  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0898  steroid monooxygenase  55.99 
 
 
539 aa  662    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0124072  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1840  FAD dependent oxidoreductase  44.08 
 
 
573 aa  496  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.445434  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1038  cyclohexanone monooxygenase  44.16 
 
 
540 aa  491  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1490  putative monooxygenase  44.42 
 
 
542 aa  478  1e-134  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.211285  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0330  FAD dependent oxidoreductase  46.01 
 
 
540 aa  477  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.282473 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0813  cyclohexanone monooxygenase  45.03 
 
 
543 aa  477  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0322706  normal  0.777116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0320  FAD dependent oxidoreductase  45.54 
 
 
543 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0643133  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3838  cyclohexanone monooxygenase  43.37 
 
 
554 aa  478  1e-133  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0311  FAD dependent oxidoreductase  45.82 
 
 
540 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4546  FAD dependent oxidoreductase  45.68 
 
 
524 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7142  FAD dependent oxidoreductase  42.49 
 
 
555 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.47055  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1220  flavin-containing monooxygenase FMO  42.91 
 
 
552 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.366472  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1860  FAD dependent oxidoreductase  42.73 
 
 
554 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.135048  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2894  cyclohexanone monooxygenase  43.68 
 
 
536 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293401  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3588  cyclohexanone monooxygenase  42.18 
 
 
540 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.558327  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1781  cyclohexanone monooxygenase  39.53 
 
 
544 aa  449  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.177006 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0579  cyclohexanone monooxygenase  41.25 
 
 
559 aa  443  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000280037 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3429  FAD dependent oxidoreductase  43.86 
 
 
544 aa  443  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2915  cyclohexanone monooxygenase  41.89 
 
 
546 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.245138  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5461  flavin-containing monooxygenase FMO  42.19 
 
 
530 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0607  cyclohexanone monooxygenase  41.14 
 
 
550 aa  434  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195368 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0522  cyclohexanone monooxygenase  39.58 
 
 
548 aa  425  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.430737  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1558  flavin-containing monooxygenase FMO  39.3 
 
 
567 aa  427  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.228791  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0500  cyclohexanone monooxygenase  39.58 
 
 
548 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0511  cyclohexanone monooxygenase  39.58 
 
 
548 aa  425  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.016866  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2176  cyclohexanone monooxygenase  40.75 
 
 
559 aa  425  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.665097  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1530  flavin-containing monooxygenase FMO  39.96 
 
 
540 aa  425  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5565  flavin-containing monooxygenase FMO  39.47 
 
 
539 aa  422  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.192347  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0337  cyclohexanone monooxygenase  38.56 
 
 
547 aa  424  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000922158  normal  0.0121848 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1480  cyclohexanone monooxygenase  39.22 
 
 
549 aa  416  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.693995  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00027  steroid monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G00440)  38.39 
 
 
544 aa  409  1e-113  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0766369  normal  0.112462 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2072  putative fusion protein  38.67 
 
 
884 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.987766  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5034  Cyclohexanone monooxygenase  38.11 
 
 
541 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.623836 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5297  FAD dependent oxidoreductase  38.92 
 
 
552 aa  406  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2013  cyclohexanone monooxygenase  39.19 
 
 
542 aa  402  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157904  normal  0.467237 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1771  hypothetical protein  39.29 
 
 
539 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0276  putative cyclohexanone monooxygenase  35.53 
 
 
551 aa  399  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1837  hypothetical protein  39.29 
 
 
539 aa  398  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4332  cyclohexanone monooxygenase  39.41 
 
 
541 aa  396  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.483661  normal  0.91016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1790  hypothetical protein  39.29 
 
 
539 aa  398  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.784099  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57936  Cyclopentanone 1,2-monooxygenase (CPMO)  36.31 
 
 
540 aa  372  1e-101  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03488  cyclohexanone monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09400)  36.81 
 
 
554 aa  368  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07793  conserved hypothetical protein  34.99 
 
 
717 aa  355  1e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.185522 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0510  cyclohexanone monooxygenase  37.24 
 
 
545 aa  353  2.9999999999999997e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04151  steroid monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G00440)  33.83 
 
 
542 aa  350  4e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2102  cyclohexanone monooxygenase  37.64 
 
 
517 aa  327  3e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.200217  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05421  steroid monooxygenase (CpmA), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07490)  31.02 
 
 
542 aa  301  3e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.465779  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16420  predicted flavoprotein involved in K+ transport  31.27 
 
 
525 aa  241  2.9999999999999997e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7122  flavin-containing monooxygenase FMO  30.06 
 
 
490 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1882  FAD dependent oxidoreductase  28.71 
 
 
487 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4546  Cyclohexanone monooxygenase  30.96 
 
 
503 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.995247  normal  0.936634 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1834  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.35 
 
 
484 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.112506  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4177  cyclohexanone monooxygenase  30.96 
 
 
503 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231059  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4690  Cyclohexanone monooxygenase  30.49 
 
 
490 aa  217  5e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.557659  normal  0.132484 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6818  putative flavin-binding monooxygenase  29.34 
 
 
479 aa  216  8e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0977  putative flavin-binding monooxygenase  30.41 
 
 
499 aa  214  3.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.321633 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3600  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.98 
 
 
816 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.188476  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3505  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.56 
 
 
818 aa  213  7e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0114186 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5336  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.75 
 
 
816 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37380  putative flavin-binding monooxygenase  29.34 
 
 
491 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000202152  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0366  FAD dependent oxidoreductase  29.58 
 
 
484 aa  211  3e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11422  monoxygenase  27.94 
 
 
491 aa  211  3e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.178527  normal  0.251324 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3920  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.12 
 
 
816 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.41262  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1697  monooxygenase FAD-binding protein  30.89 
 
 
605 aa  207  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.293831 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3824  putative flavin-binding monooxygenase  29.2 
 
 
493 aa  205  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.278459  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1890  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  28.34 
 
 
491 aa  204  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0239259  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0586  putative flavin-binding monooxygenase  28.86 
 
 
514 aa  204  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.643741  normal  0.361542 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0043  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  28.8 
 
 
487 aa  203  6e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0895  cyclohexanone monooxygenase  27.35 
 
 
491 aa  203  8e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.970799 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3703  FAD dependent oxidoreductase  28.84 
 
 
662 aa  202  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2514  lipolytic protein  28.02 
 
 
816 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24723  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1165  cyclohexanone monooxygenase  30.69 
 
 
604 aa  201  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.785376  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2415  cyclohexanone monooxygenase  27.91 
 
 
497 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2421  cyclohexanone monooxygenase  27.91 
 
 
498 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.423318  normal  0.213742 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2374  cyclohexanone monooxygenase  27.91 
 
 
498 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.845854  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2048  flavin-containing monooxygenase FMO  28.02 
 
 
484 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2671  cyclohexanone monooxygenase  28.51 
 
 
498 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558971  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3427  putative monooxygenase  29.46 
 
 
483 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.16956 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3747  FAD dependent oxidoreductase  26.52 
 
 
484 aa  198  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1273  putative flavin-binding monooxygenase-like protein  28.77 
 
 
493 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.256027 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4269  FAD dependent oxidoreductase  27.11 
 
 
512 aa  197  6e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0844717  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3598  flavin-containing monooxygenase FMO  27.53 
 
 
524 aa  197  6e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0459  FAD dependent oxidoreductase  28.51 
 
 
520 aa  196  7e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0671859 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2620  cyclohexanone monooxygenase  26.88 
 
 
517 aa  196  9e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.581774  normal  0.881203 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28920  predicted flavoprotein involved in K+ transport  30.42 
 
 
505 aa  195  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.264104 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4837  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.14 
 
 
506 aa  196  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.685298  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2885  putative flavin-binding monooxygenase  27.68 
 
 
489 aa  194  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1636  Phenylacetone monooxygenase  29 
 
 
603 aa  194  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.672961  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4019  FAD dependent oxidoreductase  28.14 
 
 
525 aa  194  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.122722  normal  0.797146 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1956  putative flavin-binding monooxygenase-like  28.38 
 
 
496 aa  193  7e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340923  normal  0.160149 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0551  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.88 
 
 
496 aa  193  7e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.635944  normal  0.310204 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0561  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.88 
 
 
496 aa  193  7e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>