More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1165 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1636  Phenylacetone monooxygenase  56.67 
 
 
603 aa  729    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.672961  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1165  cyclohexanone monooxygenase  100 
 
 
604 aa  1254    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.785376  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1623  cyclohexanone monooxygenase  53.82 
 
 
606 aa  656    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.562101  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4867  Cyclohexanone monooxygenase  53.7 
 
 
653 aa  629  1e-179  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3696  hypothetical protein  49.26 
 
 
608 aa  607  9.999999999999999e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.761481  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1697  monooxygenase FAD-binding protein  52.84 
 
 
605 aa  605  1.0000000000000001e-171  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.293831 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4961  FAD dependent oxidoreductase  51.59 
 
 
613 aa  596  1e-169  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.92657 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1789  cyclohexanone monooxygenase  50.91 
 
 
614 aa  591  1e-167  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4492  cyclohexanone monooxygenase  50.41 
 
 
611 aa  587  1e-166  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315924  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4786  cyclohexanone monooxygenase  50.41 
 
 
611 aa  587  1e-166  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4405  cyclohexanone monooxygenase  50.41 
 
 
611 aa  587  1e-166  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.339327  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08381  conserved hypothetical protein  38.99 
 
 
683 aa  442  1e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.710765  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08379  conserved hypothetical protein  38.99 
 
 
745 aa  408  1.0000000000000001e-112  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1490  putative monooxygenase  34.15 
 
 
542 aa  272  1e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.211285  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1840  FAD dependent oxidoreductase  32.56 
 
 
573 aa  260  5.0000000000000005e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.445434  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1558  flavin-containing monooxygenase FMO  33.52 
 
 
567 aa  259  7e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.228791  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3838  cyclohexanone monooxygenase  32.91 
 
 
554 aa  258  3e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0813  cyclohexanone monooxygenase  33.74 
 
 
543 aa  254  5.000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0322706  normal  0.777116 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2072  putative fusion protein  32.04 
 
 
884 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.987766  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1860  FAD dependent oxidoreductase  33.53 
 
 
554 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.135048  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5565  flavin-containing monooxygenase FMO  30.99 
 
 
539 aa  246  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.192347  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1771  hypothetical protein  32.73 
 
 
539 aa  246  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1837  hypothetical protein  32.91 
 
 
539 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0500  cyclohexanone monooxygenase  32.21 
 
 
548 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1790  hypothetical protein  32.91 
 
 
539 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.784099  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0522  cyclohexanone monooxygenase  32.21 
 
 
548 aa  244  3e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.430737  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0511  cyclohexanone monooxygenase  32.21 
 
 
548 aa  244  3e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.016866  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0330  FAD dependent oxidoreductase  33.47 
 
 
540 aa  243  7e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.282473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0320  FAD dependent oxidoreductase  33.47 
 
 
543 aa  243  7e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0643133  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2176  cyclohexanone monooxygenase  33.81 
 
 
559 aa  242  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.665097  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2915  cyclohexanone monooxygenase  32.72 
 
 
546 aa  241  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.245138  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5461  flavin-containing monooxygenase FMO  31.59 
 
 
530 aa  242  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0898  steroid monooxygenase  31.42 
 
 
539 aa  238  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0124072  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7142  FAD dependent oxidoreductase  31.24 
 
 
555 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.47055  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1530  flavin-containing monooxygenase FMO  30.24 
 
 
540 aa  235  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0311  FAD dependent oxidoreductase  33.08 
 
 
540 aa  232  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1220  flavin-containing monooxygenase FMO  31.54 
 
 
552 aa  231  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.366472  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5034  Cyclohexanone monooxygenase  31.27 
 
 
541 aa  228  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.623836 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0607  cyclohexanone monooxygenase  29.93 
 
 
550 aa  227  4e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195368 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4332  cyclohexanone monooxygenase  30.96 
 
 
541 aa  226  8e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.483661  normal  0.91016 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3588  cyclohexanone monooxygenase  30.24 
 
 
540 aa  226  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.558327  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28920  predicted flavoprotein involved in K+ transport  30.56 
 
 
505 aa  225  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.264104 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1038  cyclohexanone monooxygenase  30.95 
 
 
540 aa  225  2e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4546  Cyclohexanone monooxygenase  31.24 
 
 
503 aa  224  3e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.995247  normal  0.936634 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4177  cyclohexanone monooxygenase  31.24 
 
 
503 aa  224  4e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231059  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00027  steroid monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G00440)  29.64 
 
 
544 aa  224  4e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0766369  normal  0.112462 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4546  FAD dependent oxidoreductase  31.26 
 
 
524 aa  224  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2013  cyclohexanone monooxygenase  31.72 
 
 
542 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157904  normal  0.467237 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2894  cyclohexanone monooxygenase  32.38 
 
 
536 aa  221  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293401  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5626  flavin-containing monooxygenase FMO  30.63 
 
 
526 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0554215  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3694  flavin-containing monooxygenase FMO  30.63 
 
 
526 aa  220  5e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920418  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4674  flavin-containing monooxygenase FMO  30.63 
 
 
526 aa  220  5e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.727347  normal  0.236948 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4690  Cyclohexanone monooxygenase  31.24 
 
 
490 aa  220  6e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.557659  normal  0.132484 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0337  cyclohexanone monooxygenase  30.92 
 
 
547 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000922158  normal  0.0121848 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1088  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  33.33 
 
 
499 aa  218  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.437859  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3429  FAD dependent oxidoreductase  30.29 
 
 
544 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1145  flavin-containing monooxygenase FMO  29.82 
 
 
529 aa  218  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.854282  normal  0.14107 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4019  FAD dependent oxidoreductase  30.22 
 
 
525 aa  217  5e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.122722  normal  0.797146 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4068  flavin-containing monooxygenase FMO  30.43 
 
 
529 aa  217  5e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.252567 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4526  flavin-containing monooxygenase FMO  30.43 
 
 
526 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.249427 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3835  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.9 
 
 
485 aa  216  9e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5449  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.46 
 
 
488 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.296098 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1471  flavin-binding monooxygenase-like protein  29.35 
 
 
524 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0579  cyclohexanone monooxygenase  29.75 
 
 
559 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000280037 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1498  flavin-binding monooxygenase-like protein  29.37 
 
 
524 aa  215  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967842  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3461  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 
548 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00115116  normal  0.0283002 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0610  steroid monooxygenase  31.17 
 
 
606 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0189312 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37380  putative flavin-binding monooxygenase  30.31 
 
 
491 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000202152  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1480  cyclohexanone monooxygenase  29.98 
 
 
549 aa  213  5.999999999999999e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.693995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2421  cyclohexanone monooxygenase  32.1 
 
 
498 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.423318  normal  0.213742 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2374  cyclohexanone monooxygenase  32.1 
 
 
498 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.845854  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2415  cyclohexanone monooxygenase  32.1 
 
 
497 aa  213  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3904  FAD dependent oxidoreductase  30.69 
 
 
548 aa  212  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.955647  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0558  4-hydroxyacetophenone monooxygenase  29.15 
 
 
529 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0347496  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1837  FAD dependent oxidoreductase  30.29 
 
 
547 aa  211  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131168  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1347  putative monooxygenase  29.15 
 
 
529 aa  212  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2526  flavin-binding monooxygenase-like protein  29.15 
 
 
524 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1009  flavin-containing monooxygenase FMO  29.15 
 
 
529 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.449884  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1270  putative monooxygenase  29.15 
 
 
529 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1834  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.71 
 
 
484 aa  209  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.112506  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0510  cyclohexanone monooxygenase  33.65 
 
 
545 aa  209  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0184  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.02 
 
 
495 aa  208  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3530  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.69 
 
 
500 aa  208  3e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16420  predicted flavoprotein involved in K+ transport  29.46 
 
 
525 aa  208  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11422  monoxygenase  31.25 
 
 
491 aa  208  3e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.178527  normal  0.251324 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3256  putative monooxygenase  30.54 
 
 
505 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.243228  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4608  FAD dependent oxidoreductase  31.18 
 
 
556 aa  207  4e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3194  putative monooxygenase  30.54 
 
 
505 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3203  putative monooxygenase  30.54 
 
 
505 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0255813  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1351  steroid monooxygenase  30.18 
 
 
541 aa  207  6e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.881234  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0721  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.93 
 
 
495 aa  207  6e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0504093 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1528  FAD-binding monooxygenase, putative  30.82 
 
 
496 aa  205  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.149589  normal  0.0289416 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0276  putative cyclohexanone monooxygenase  28.01 
 
 
551 aa  205  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4269  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 
512 aa  205  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0844717  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0826  flavin-containing monooxygenase FMO  31.01 
 
 
487 aa  204  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378044 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2283  phenylacetone monooxygenase  29.34 
 
 
554 aa  204  4e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1789  flavin-binding monooxygenase  28.57 
 
 
531 aa  201  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000161654 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57936  Cyclopentanone 1,2-monooxygenase (CPMO)  29.53 
 
 
540 aa  201  3.9999999999999996e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0561  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.96 
 
 
496 aa  200  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0573  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.96 
 
 
496 aa  200  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.230445  hitchhiker  0.00837864 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>