More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1979 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008062  Bcen_6098  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  100 
 
 
294 aa  586  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1979  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  100 
 
 
294 aa  586  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.646379  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2003  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  97.96 
 
 
294 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5291  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  95.92 
 
 
294 aa  564  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0328744 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5532  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent:6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  68.64 
 
 
292 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2294  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  62.59 
 
 
299 aa  351  7e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3180  NAD-binding protein  62.24 
 
 
299 aa  348  7e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3051  NAD-binding protein  61.89 
 
 
299 aa  346  3e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.296825  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2000  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  61.89 
 
 
295 aa  345  4e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1021  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  61.89 
 
 
299 aa  345  4e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.280328  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1397  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  61.89 
 
 
295 aa  345  4e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298595  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2287  NAD-binding protein  61.89 
 
 
299 aa  345  4e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1309  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  61.89 
 
 
299 aa  345  4e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0338  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.52 
 
 
298 aa  145  1e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2547  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  32.63 
 
 
286 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0364167 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7152  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  32.3 
 
 
291 aa  137  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2197  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.92 
 
 
290 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206144  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1372  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase family protein  32.87 
 
 
286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.90333  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3356  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  28.62 
 
 
286 aa  132  9e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0320622 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2984  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  32.88 
 
 
293 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0351  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  32.04 
 
 
287 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0588  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  30.66 
 
 
287 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0331  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  32.04 
 
 
287 aa  125  7e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-16 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1857  3-hydroxyacid dehydrogenase  30.5 
 
 
288 aa  124  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.341144  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3011  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  32.17 
 
 
287 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000101253  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4859  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  31.25 
 
 
297 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.748222  normal  0.158599 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0722  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.68 
 
 
296 aa  119  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0699  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  29.41 
 
 
286 aa  119  7.999999999999999e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000621245 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1952  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  27.62 
 
 
289 aa  119  9e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2760  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  28.52 
 
 
298 aa  118  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0685188  normal  0.814405 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0209  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  28.52 
 
 
294 aa  118  9.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1759  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  29.62 
 
 
289 aa  118  9.999999999999999e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.271447 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6528  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  29.51 
 
 
297 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.186276  normal  0.100696 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3884  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  29.48 
 
 
292 aa  113  5e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3206  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  30.18 
 
 
282 aa  112  9e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.308365 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1714  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  28.08 
 
 
309 aa  112  9e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.280932  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2852  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  28.57 
 
 
297 aa  112  9e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0134215  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08160  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  30.18 
 
 
298 aa  112  9e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0460  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  27.11 
 
 
294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0485372  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0555  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  30.72 
 
 
299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0628  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  29.33 
 
 
293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3078  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  26.99 
 
 
297 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.231131  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3042  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  26.99 
 
 
297 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3864  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  27.72 
 
 
297 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0721878  normal  0.335239 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00459  tartronate semialdehyde reductase, NADH-dependent  27.92 
 
 
292 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3103  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  27.92 
 
 
292 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0546  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  27.92 
 
 
292 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3113  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  27.92 
 
 
292 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.327741 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4864  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase GcxR  27.43 
 
 
295 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.902474  normal  0.691773 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2531  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  31.47 
 
 
292 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3351  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  28.22 
 
 
303 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561404  hitchhiker  0.00525216 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0261  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  27.49 
 
 
305 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0646517 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00464  hypothetical protein  27.92 
 
 
292 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0583  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  27.92 
 
 
292 aa  107  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1159  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  31.58 
 
 
292 aa  107  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.997729  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0898  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  28.83 
 
 
314 aa  107  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00998968  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0552  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  27.92 
 
 
292 aa  106  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1265  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  30.04 
 
 
284 aa  106  5e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.92382  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4299  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  27.37 
 
 
297 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1979  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  30.5 
 
 
288 aa  106  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1570  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  27.02 
 
 
297 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101448  normal  0.880113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6898  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  32.29 
 
 
296 aa  105  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0957  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  29.45 
 
 
305 aa  105  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0610  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  27.56 
 
 
292 aa  105  9e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0425  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding protein  29.76 
 
 
294 aa  104  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1173  tartronate semialdehyde reductase  28.35 
 
 
296 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0175  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  30.53 
 
 
293 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.490662  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2389  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  27.27 
 
 
289 aa  103  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0875  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  33.45 
 
 
289 aa  104  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.290267  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3437  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  28.22 
 
 
292 aa  104  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43420  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  29.37 
 
 
296 aa  103  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.164862  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1712  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  30.07 
 
 
298 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.032164  normal  0.768061 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3293  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  29.25 
 
 
306 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4692  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  31.12 
 
 
296 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.995907 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2775  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  28.07 
 
 
288 aa  103  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0544737  normal  0.212315 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1632  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  28.72 
 
 
303 aa  102  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4604  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding protein  31.12 
 
 
299 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3551  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  26.32 
 
 
292 aa  103  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000115044  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0271  oxidoreductase  32.2 
 
 
289 aa  102  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00375643  unclonable  0.00000071713 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3685  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  32.54 
 
 
289 aa  102  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000821613  hitchhiker  0.000000000000410603 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_45774  predicted protein  27.11 
 
 
283 aa  102  7e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2700  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  29.68 
 
 
302 aa  102  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3094  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  28.57 
 
 
303 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0518605 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2089  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  32.64 
 
 
297 aa  101  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.509497  normal  0.161709 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1098  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  27.34 
 
 
312 aa  102  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0295  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  31.37 
 
 
280 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3379  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  29.9 
 
 
291 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0410434 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0573  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  28.17 
 
 
292 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6215  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  26.43 
 
 
311 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0695059  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4310  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  25.26 
 
 
294 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0860064 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0566  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  28.17 
 
 
292 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3343  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  27.08 
 
 
303 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2175  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  26.69 
 
 
290 aa  101  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00502561  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0568  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  28.17 
 
 
292 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36270  putative dehydrogenase  28.38 
 
 
291 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0172654 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3690  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  27.87 
 
 
292 aa  102  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7094  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  30.28 
 
 
293 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444897  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2221  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  30.63 
 
 
297 aa  100  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3624  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  26.32 
 
 
297 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3450  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  29.25 
 
 
307 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>