34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3294 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_3294  lipase chaperone  100 
 
 
344 aa  658    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.704339  normal  0.691191 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3810  lipase chaperone  96.8 
 
 
344 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.492259  normal  0.918403 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3611  lipase chaperone  85.47 
 
 
344 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4450  lipase chaperone  85.47 
 
 
344 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3916  lipase chaperone  85.47 
 
 
344 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.831951  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2172  lipase chaperone  84.01 
 
 
344 aa  532  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0157769  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4667  lipase chaperone  78.17 
 
 
352 aa  436  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0640  lipase chaperone  71.38 
 
 
344 aa  374  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0601926  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0429  lipase chaperone  64.9 
 
 
344 aa  362  4e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0479  lipase chaperone  64.9 
 
 
344 aa  362  4e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0853768  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2504  lipase chaperone  64.9 
 
 
344 aa  362  4e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1808  lipase chaperone  64.9 
 
 
344 aa  362  4e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0818  lipase chaperone  64.9 
 
 
344 aa  362  6e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.330941  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2365  lipase chaperone  65.19 
 
 
344 aa  362  6e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.710136  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0463  lipase chaperone  49.42 
 
 
353 aa  311  9e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0312801  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1944  lipase chaperone  51.11 
 
 
342 aa  227  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153656  hitchhiker  0.00743529 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3795  lipase chaperone  38.04 
 
 
351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5358  lipase chaperone  27.49 
 
 
343 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.322306  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0808  lipase chaperone  31.74 
 
 
340 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.49046  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0738  lipase chaperone  32.31 
 
 
350 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.942726  normal  0.612354 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1764  lipase chaperone  33.33 
 
 
352 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1143  lipase chaperone  25 
 
 
364 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2291  lipase chaperone  30.07 
 
 
340 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2565  lipase chaperone  30.1 
 
 
339 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18618  hitchhiker  0.000000000061931 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27090  lipase chaperone  29.15 
 
 
288 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3357  lipase chaperone  31.17 
 
 
322 aa  68.9  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0444  lipase chaperone  27.21 
 
 
370 aa  67  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0969  lipase chaperone  28.37 
 
 
373 aa  60.5  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000678891 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0524  lipase modulator  51.16 
 
 
44 aa  53.5  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0992621  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3177  lipase chaperone-like protein  23.87 
 
 
322 aa  49.7  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02697  lipase chaperone  27.94 
 
 
284 aa  47.4  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0792  hypothetical protein  37.36 
 
 
117 aa  47  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4190  lipase chaperone-like protein  31.63 
 
 
340 aa  47  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3850  lipase chaperone-like protein  29.57 
 
 
332 aa  42.7  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>