19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4190 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4190  lipase chaperone-like protein  100 
 
 
340 aa  641    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1764  lipase chaperone  32.09 
 
 
352 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3795  lipase chaperone  29.03 
 
 
351 aa  62.8  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2291  lipase chaperone  32.11 
 
 
340 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27090  lipase chaperone  33.33 
 
 
288 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2565  lipase chaperone  32.42 
 
 
339 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18618  hitchhiker  0.000000000061931 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3357  lipase chaperone  29.18 
 
 
322 aa  59.3  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5358  lipase chaperone  33.58 
 
 
343 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.322306  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3916  lipase chaperone  30.91 
 
 
344 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.831951  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4450  lipase chaperone  30.91 
 
 
344 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3611  lipase chaperone  30.91 
 
 
344 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3810  lipase chaperone  30.86 
 
 
344 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.492259  normal  0.918403 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3294  lipase chaperone  30.45 
 
 
344 aa  53.1  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.704339  normal  0.691191 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1005  lipase chaperone  27.74 
 
 
284 aa  51.2  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0167036  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2172  lipase chaperone  29.55 
 
 
344 aa  51.2  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0157769  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1097  hypothetical protein  28.1 
 
 
343 aa  48.5  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0444  lipase chaperone  25 
 
 
370 aa  45.1  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00661  lipase chaperone  25.46 
 
 
329 aa  43.9  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4667  lipase chaperone  34.29 
 
 
352 aa  43.1  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>