35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3357 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3357  lipase chaperone  100 
 
 		 322 aa  635    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5358  lipase chaperone  28.18 
 
 		 343 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.322306  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27090  lipase chaperone  32.08 
 
 		 288 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2291  lipase chaperone  32.67 
 
 		 340 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2565  lipase chaperone  28.06 
 
 		 339 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18618  hitchhiker  0.000000000061931 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0444  lipase chaperone  28.35 
 
 		 370 aa  84  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3611  lipase chaperone  36.48 
 
 		 344 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4450  lipase chaperone  36.48 
 
 		 344 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3916  lipase chaperone  36.48 
 
 		 344 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.831951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1143  lipase chaperone  23.74 
 
 		 364 aa  71.2  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2172  lipase chaperone  33.96 
 
 		 344 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0157769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3294  lipase chaperone  31.17 
 
 		 344 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.704339  normal  0.691191 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3810  lipase chaperone  35.26 
 
 		 344 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.492259  normal  0.918403 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0808  lipase chaperone  26.4 
 
 		 340 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.49046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0969  lipase chaperone  26.21 
 
 		 373 aa  63.9  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000678891 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1944  lipase chaperone  30.4 
 
 		 342 aa  62  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153656  hitchhiker  0.00743529 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1808  lipase chaperone  28.45 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2504  lipase chaperone  28.45 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0479  lipase chaperone  28.45 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0853768  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0429  lipase chaperone  28.45 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00661  lipase chaperone  30.2 
 
 		 329 aa  59.7  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2365  lipase chaperone  28.93 
 
 		 344 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.710136  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0818  lipase chaperone  28.93 
 
 		 344 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.330941  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1764  lipase chaperone  27.56 
 
 		 352 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02697  lipase chaperone  26.57 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0640  lipase chaperone  27.76 
 
 		 344 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0601926  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0738  lipase chaperone  25.78 
 
 		 350 aa  53.5  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.942726  normal  0.612354 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4667  lipase chaperone  33.54 
 
 		 352 aa  52  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3177  lipase chaperone-like protein  24.14 
 
 		 322 aa  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0463  lipase chaperone  25.38 
 
 		 353 aa  51.6  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0312801  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003807  lipase chaperone  25 
 
 		 286 aa  49.7  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1005  lipase chaperone  25.52 
 
 		 284 aa  47  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0167036  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3795  lipase chaperone  34.21 
 
 		 351 aa  45.8  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4190  lipase chaperone-like protein  29.53 
 
 		 340 aa  45.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3850  lipase chaperone-like protein  26.5 
 
 		 332 aa  45.1  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>