34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3810 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3810  lipase chaperone  100 
 
 		 344 aa  654    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.492259  normal  0.918403 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3294  lipase chaperone  96.8 
 
 		 344 aa  594  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.704339  normal  0.691191 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3611  lipase chaperone  86.01 
 
 		 344 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4450  lipase chaperone  86.01 
 
 		 344 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3916  lipase chaperone  86.01 
 
 		 344 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.831951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2172  lipase chaperone  84.01 
 
 		 344 aa  533  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0157769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4667  lipase chaperone  77.58 
 
 		 352 aa  434  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0640  lipase chaperone  71.74 
 
 		 344 aa  375  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0601926  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0429  lipase chaperone  65.49 
 
 		 344 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0479  lipase chaperone  65.49 
 
 		 344 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0853768  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2365  lipase chaperone  65.78 
 
 		 344 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.710136  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2504  lipase chaperone  65.49 
 
 		 344 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1808  lipase chaperone  65.49 
 
 		 344 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0818  lipase chaperone  65.49 
 
 		 344 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.330941  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0463  lipase chaperone  49.13 
 
 		 353 aa  308  8e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0312801  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1944  lipase chaperone  51.85 
 
 		 342 aa  232  9e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153656  hitchhiker  0.00743529 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3795  lipase chaperone  37.18 
 
 		 351 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5358  lipase chaperone  28.33 
 
 		 343 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.322306  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0808  lipase chaperone  32.65 
 
 		 340 aa  93.2  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.49046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0738  lipase chaperone  32.99 
 
 		 350 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.942726  normal  0.612354 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1764  lipase chaperone  32.97 
 
 		 352 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1143  lipase chaperone  25 
 
 		 364 aa  74.3  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27090  lipase chaperone  29.01 
 
 		 288 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2291  lipase chaperone  28.91 
 
 		 340 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3357  lipase chaperone  30.45 
 
 		 322 aa  69.3  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0444  lipase chaperone  27.1 
 
 		 370 aa  68.9  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2565  lipase chaperone  29.81 
 
 		 339 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18618  hitchhiker  0.000000000061931 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0969  lipase chaperone  29.08 
 
 		 373 aa  60.5  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000678891 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0524  lipase modulator  51.16 
 
 		 44 aa  50.1  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0992621  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3177  lipase chaperone-like protein  23.87 
 
 		 322 aa  49.3  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4190  lipase chaperone-like protein  32.14 
 
 		 340 aa  48.5  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02697  lipase chaperone  27.94 
 
 		 284 aa  48.1  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0792  hypothetical protein  37.36 
 
 		 117 aa  47.4  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3850  lipase chaperone-like protein  29.61 
 
 		 332 aa  43.5  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>