23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3850 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3850  lipase chaperone-like protein  100 
 
 		 332 aa  674    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3177  lipase chaperone-like protein  37.08 
 
 		 322 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1097  hypothetical protein  41.2 
 
 		 343 aa  170  4e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00661  lipase chaperone  30.96 
 
 		 329 aa  87.4  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3357  lipase chaperone  26.5 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3916  lipase chaperone  28.69 
 
 		 344 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.831951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3611  lipase chaperone  28.69 
 
 		 344 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4450  lipase chaperone  28.69 
 
 		 344 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0640  lipase chaperone  28.05 
 
 		 344 aa  53.5  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0601926  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0429  lipase chaperone  27.76 
 
 		 344 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1808  lipase chaperone  27.76 
 
 		 344 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2504  lipase chaperone  27.76 
 
 		 344 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0479  lipase chaperone  27.76 
 
 		 344 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0853768  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2365  lipase chaperone  27.76 
 
 		 344 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.710136  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2172  lipase chaperone  28.11 
 
 		 344 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0157769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0818  lipase chaperone  27.76 
 
 		 344 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.330941  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2291  lipase chaperone  24.67 
 
 		 340 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27090  lipase chaperone  24.67 
 
 		 288 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4667  lipase chaperone  26.53 
 
 		 352 aa  48.1  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3810  lipase chaperone  28.57 
 
 		 344 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.492259  normal  0.918403 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3294  lipase chaperone  28.51 
 
 		 344 aa  47  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.704339  normal  0.691191 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1944  lipase chaperone  25.31 
 
 		 342 aa  43.9  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153656  hitchhiker  0.00743529 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0444  lipase chaperone  24.88 
 
 		 370 aa  43.5  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>