31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3795 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3795  lipase chaperone  100 
 
 		 351 aa  696    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2172  lipase chaperone  39.93 
 
 		 344 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0157769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3611  lipase chaperone  39.64 
 
 		 344 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4450  lipase chaperone  39.64 
 
 		 344 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3916  lipase chaperone  39.64 
 
 		 344 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.831951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3294  lipase chaperone  40 
 
 		 344 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.704339  normal  0.691191 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3810  lipase chaperone  39.5 
 
 		 344 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.492259  normal  0.918403 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0640  lipase chaperone  39.71 
 
 		 344 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0601926  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0429  lipase chaperone  38.77 
 
 		 344 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0479  lipase chaperone  38.77 
 
 		 344 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0853768  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2504  lipase chaperone  38.77 
 
 		 344 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1808  lipase chaperone  38.77 
 
 		 344 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2365  lipase chaperone  38.77 
 
 		 344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.710136  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0818  lipase chaperone  38.77 
 
 		 344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.330941  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0463  lipase chaperone  34.9 
 
 		 353 aa  120  3e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0312801  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0808  lipase chaperone  34.84 
 
 		 340 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.49046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4667  lipase chaperone  38.18 
 
 		 352 aa  116  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1944  lipase chaperone  35.42 
 
 		 342 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153656  hitchhiker  0.00743529 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5358  lipase chaperone  29.89 
 
 		 343 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.322306  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0738  lipase chaperone  33.45 
 
 		 350 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.942726  normal  0.612354 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2291  lipase chaperone  32.96 
 
 		 340 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27090  lipase chaperone  32.96 
 
 		 288 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1764  lipase chaperone  31.64 
 
 		 352 aa  87  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2565  lipase chaperone  28.57 
 
 		 339 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18618  hitchhiker  0.000000000061931 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1143  lipase chaperone  24.18 
 
 		 364 aa  68.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4190  lipase chaperone-like protein  31.01 
 
 		 340 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0444  lipase chaperone  27.24 
 
 		 370 aa  65.5  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3357  lipase chaperone  34.21 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0969  lipase chaperone  27.03 
 
 		 373 aa  55.5  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000678891 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0792  hypothetical protein  43.08 
 
 		 117 aa  50.8  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1097  hypothetical protein  28.03 
 
 		 343 aa  48.5  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>