19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0792 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0792  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  225  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0738  lipase chaperone  58.25 
 
 		 350 aa  115  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.942726  normal  0.612354 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0808  lipase chaperone  57.28 
 
 		 340 aa  110  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.49046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4667  lipase chaperone  39.56 
 
 		 352 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0640  lipase chaperone  38.46 
 
 		 344 aa  47  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0601926  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3810  lipase chaperone  37.36 
 
 		 344 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.492259  normal  0.918403 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0818  lipase chaperone  37.36 
 
 		 344 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.330941  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3294  lipase chaperone  37.36 
 
 		 344 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.704339  normal  0.691191 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2365  lipase chaperone  37.36 
 
 		 344 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.710136  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1808  lipase chaperone  37.36 
 
 		 344 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3611  lipase chaperone  36.26 
 
 		 344 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0479  lipase chaperone  37.36 
 
 		 344 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0853768  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2504  lipase chaperone  37.36 
 
 		 344 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3916  lipase chaperone  36.26 
 
 		 344 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.831951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4450  lipase chaperone  36.26 
 
 		 344 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0429  lipase chaperone  37.36 
 
 		 344 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3795  lipase chaperone  45.83 
 
 		 351 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2172  lipase chaperone  34.07 
 
 		 344 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0157769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5358  lipase chaperone  38.71 
 
 		 343 aa  40  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.322306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>