33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5358 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5358  lipase chaperone  100 
 
 
343 aa  684    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.322306  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2291  lipase chaperone  37.43 
 
 
340 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2565  lipase chaperone  36.13 
 
 
339 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18618  hitchhiker  0.000000000061931 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27090  lipase chaperone  36.9 
 
 
288 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0444  lipase chaperone  32.85 
 
 
370 aa  146  6e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1143  lipase chaperone  29.21 
 
 
364 aa  126  5e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3357  lipase chaperone  29.94 
 
 
322 aa  117  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0969  lipase chaperone  28.87 
 
 
373 aa  117  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000678891 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2172  lipase chaperone  29.71 
 
 
344 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0157769  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0808  lipase chaperone  31.16 
 
 
340 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.49046  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3795  lipase chaperone  29.89 
 
 
351 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3916  lipase chaperone  28.62 
 
 
344 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.831951  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3611  lipase chaperone  28.62 
 
 
344 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4450  lipase chaperone  28.62 
 
 
344 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3810  lipase chaperone  28.32 
 
 
344 aa  95.9  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.492259  normal  0.918403 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4667  lipase chaperone  29.66 
 
 
352 aa  94.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3294  lipase chaperone  27.54 
 
 
344 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.704339  normal  0.691191 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0738  lipase chaperone  30.75 
 
 
350 aa  89.7  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.942726  normal  0.612354 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02697  lipase chaperone  27.94 
 
 
284 aa  86.3  8e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1764  lipase chaperone  30.95 
 
 
352 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0640  lipase chaperone  28.62 
 
 
344 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0601926  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1808  lipase chaperone  28.52 
 
 
344 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0479  lipase chaperone  28.52 
 
 
344 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0853768  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2504  lipase chaperone  28.52 
 
 
344 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0429  lipase chaperone  28.52 
 
 
344 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0818  lipase chaperone  28.52 
 
 
344 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.330941  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2365  lipase chaperone  28.52 
 
 
344 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.710136  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0463  lipase chaperone  24.29 
 
 
353 aa  74.3  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0312801  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003807  lipase chaperone  24.5 
 
 
286 aa  64.3  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1944  lipase chaperone  27.27 
 
 
342 aa  62  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153656  hitchhiker  0.00743529 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1005  lipase chaperone  26.29 
 
 
284 aa  52.4  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0167036  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4190  lipase chaperone-like protein  33.58 
 
 
340 aa  49.7  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1097  hypothetical protein  23.47 
 
 
343 aa  46.6  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>