18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02697 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02697  lipase chaperone  100 
 
 
284 aa  567  1e-161  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003807  lipase chaperone  56.79 
 
 
286 aa  308  5e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1005  lipase chaperone  42.51 
 
 
284 aa  194  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0167036  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5358  lipase chaperone  27.94 
 
 
343 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.322306  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27090  lipase chaperone  29.6 
 
 
288 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2291  lipase chaperone  29.2 
 
 
340 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2565  lipase chaperone  29.51 
 
 
339 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18618  hitchhiker  0.000000000061931 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1143  lipase chaperone  23.94 
 
 
364 aa  60.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3357  lipase chaperone  26.57 
 
 
322 aa  57.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3294  lipase chaperone  27.94 
 
 
344 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.704339  normal  0.691191 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3810  lipase chaperone  27.94 
 
 
344 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.492259  normal  0.918403 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0444  lipase chaperone  27.57 
 
 
370 aa  47  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0969  lipase chaperone  27.75 
 
 
373 aa  43.9  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000678891 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4450  lipase chaperone  26.23 
 
 
344 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3916  lipase chaperone  26.23 
 
 
344 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.831951  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3611  lipase chaperone  26.23 
 
 
344 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2365  lipase chaperone  26.45 
 
 
344 aa  42.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.710136  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0818  lipase chaperone  26.45 
 
 
344 aa  42.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.330941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>