30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1143 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1143  lipase chaperone  100 
 
 
364 aa  752    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2565  lipase chaperone  29.71 
 
 
339 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18618  hitchhiker  0.000000000061931 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2291  lipase chaperone  30.31 
 
 
340 aa  126  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27090  lipase chaperone  32.55 
 
 
288 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5358  lipase chaperone  28.9 
 
 
343 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.322306  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0969  lipase chaperone  26.15 
 
 
373 aa  97.1  4e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000678891 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0444  lipase chaperone  26.49 
 
 
370 aa  93.2  6e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1764  lipase chaperone  26.62 
 
 
352 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3357  lipase chaperone  23.74 
 
 
322 aa  71.2  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0808  lipase chaperone  23.78 
 
 
340 aa  70.5  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.49046  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0429  lipase chaperone  25.75 
 
 
344 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1808  lipase chaperone  25.75 
 
 
344 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2504  lipase chaperone  25.75 
 
 
344 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0479  lipase chaperone  25.75 
 
 
344 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0853768  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0818  lipase chaperone  25.75 
 
 
344 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.330941  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2365  lipase chaperone  25.75 
 
 
344 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.710136  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3294  lipase chaperone  24.46 
 
 
344 aa  67  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.704339  normal  0.691191 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3810  lipase chaperone  24.91 
 
 
344 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.492259  normal  0.918403 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0640  lipase chaperone  24.74 
 
 
344 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0601926  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4667  lipase chaperone  27.61 
 
 
352 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2172  lipase chaperone  24.15 
 
 
344 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0157769  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3916  lipase chaperone  24.53 
 
 
344 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.831951  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4450  lipase chaperone  24.53 
 
 
344 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3611  lipase chaperone  24.53 
 
 
344 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02697  lipase chaperone  23.94 
 
 
284 aa  60.5  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0738  lipase chaperone  23.16 
 
 
350 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.942726  normal  0.612354 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0463  lipase chaperone  24.2 
 
 
353 aa  57.4  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0312801  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3795  lipase chaperone  24.18 
 
 
351 aa  56.6  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003807  lipase chaperone  22.41 
 
 
286 aa  47.8  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1005  lipase chaperone  22.33 
 
 
284 aa  45.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0167036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>